Protein–RNA interactions for Protein: P53992

SEC24C, Protein transport protein Sec24C, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24CP53992 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms