Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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