Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK2

SOHLH1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOHLH1Q5JUK2 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SOHLH1Q5JUK2 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SOHLH1Q5JUK2 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SOHLH1Q5JUK2 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SOHLH1Q5JUK2 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SOHLH1Q5JUK2 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SOHLH1Q5JUK2 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SOHLH1Q5JUK2 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SOHLH1Q5JUK2 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SOHLH1Q5JUK2 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SOHLH1Q5JUK2 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SOHLH1Q5JUK2 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SOHLH1Q5JUK2 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SOHLH1Q5JUK2 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SOHLH1Q5JUK2 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SOHLH1Q5JUK2 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SOHLH1Q5JUK2 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SOHLH1Q5JUK2 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SOHLH1Q5JUK2 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SOHLH1Q5JUK2 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SOHLH1Q5JUK2 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SOHLH1Q5JUK2 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SOHLH1Q5JUK2 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SOHLH1Q5JUK2 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SOHLH1Q5JUK2 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SOHLH1Q5JUK2 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SOHLH1Q5JUK2 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SOHLH1Q5JUK2 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SOHLH1Q5JUK2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SOHLH1Q5JUK2 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SOHLH1Q5JUK2 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SOHLH1Q5JUK2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SOHLH1Q5JUK2 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SOHLH1Q5JUK2 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SOHLH1Q5JUK2 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SOHLH1Q5JUK2 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SOHLH1Q5JUK2 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SOHLH1Q5JUK2 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SOHLH1Q5JUK2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SOHLH1Q5JUK2 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SOHLH1Q5JUK2 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SOHLH1Q5JUK2 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SOHLH1Q5JUK2 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SOHLH1Q5JUK2 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SOHLH1Q5JUK2 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SOHLH1Q5JUK2 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SOHLH1Q5JUK2 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SOHLH1Q5JUK2 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SOHLH1Q5JUK2 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SOHLH1Q5JUK2 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SOHLH1Q5JUK2 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SOHLH1Q5JUK2 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SOHLH1Q5JUK2 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SOHLH1Q5JUK2 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SOHLH1Q5JUK2 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SOHLH1Q5JUK2 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SOHLH1Q5JUK2 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SOHLH1Q5JUK2 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SOHLH1Q5JUK2 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SOHLH1Q5JUK2 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SOHLH1Q5JUK2 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SOHLH1Q5JUK2 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SOHLH1Q5JUK2 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SOHLH1Q5JUK2 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SOHLH1Q5JUK2 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SOHLH1Q5JUK2 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SOHLH1Q5JUK2 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SOHLH1Q5JUK2 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SOHLH1Q5JUK2 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SOHLH1Q5JUK2 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SOHLH1Q5JUK2 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SOHLH1Q5JUK2 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SOHLH1Q5JUK2 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SOHLH1Q5JUK2 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SOHLH1Q5JUK2 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SOHLH1Q5JUK2 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SOHLH1Q5JUK2 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SOHLH1Q5JUK2 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SOHLH1Q5JUK2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SOHLH1Q5JUK2 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SOHLH1Q5JUK2 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SOHLH1Q5JUK2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SOHLH1Q5JUK2 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SOHLH1Q5JUK2 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SOHLH1Q5JUK2 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SOHLH1Q5JUK2 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SOHLH1Q5JUK2 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SOHLH1Q5JUK2 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SOHLH1Q5JUK2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SOHLH1Q5JUK2 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SOHLH1Q5JUK2 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SOHLH1Q5JUK2 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SOHLH1Q5JUK2 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SOHLH1Q5JUK2 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SOHLH1Q5JUK2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SOHLH1Q5JUK2 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SOHLH1Q5JUK2 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SOHLH1Q5JUK2 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SOHLH1Q5JUK2 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SOHLH1Q5JUK2 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1809.8 ms