RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380647.7

CNTLN-202, Transcript of centlein, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNTLN, Length 5,576 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTLN-202ENST00000380647 DCAF8L2P0C7V8 631 aa27.33■■□□□ 1.97
CNTLN-202ENST00000380647 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
CNTLN-202ENST00000380647 NISCHQ9Y2I1 1504 aa26.31■■□□□ 1.8
CNTLN-202ENST00000380647 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
CNTLN-202ENST00000380647 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.8■■□□□ 1.72
CNTLN-202ENST00000380647 EHMT2Q96KQ7 1210 aa25.42■■□□□ 1.66
CNTLN-202ENST00000380647 APLP2Q06481 763 aa25.41■■□□□ 1.66
CNTLN-202ENST00000380647 PCGF6Q9BYE7 350 aa25.26■■□□□ 1.63
CNTLN-202ENST00000380647 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
CNTLN-202ENST00000380647 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
CNTLN-202ENST00000380647 MYT1Q01538 1121 aa25.04■■□□□ 1.6
CNTLN-202ENST00000380647 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
CNTLN-202ENST00000380647 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
CNTLN-202ENST00000380647 ERICH6Q7L0X2 663 aa24.94■■□□□ 1.58
CNTLN-202ENST00000380647 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
CNTLN-202ENST00000380647 TRIM41Q8WV44 630 aa24.64■■□□□ 1.53
CNTLN-202ENST00000380647 NEFLP07196 543 aa24.53■■□□□ 1.52
CNTLN-202ENST00000380647 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
CNTLN-202ENST00000380647 HRCP23327 699 aa24.29■■□□□ 1.48
CNTLN-202ENST00000380647 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
CNTLN-202ENST00000380647 UBTFP17480 764 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
CNTLN-202ENST00000380647 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
CNTLN-202ENST00000380647 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
CNTLN-202ENST00000380647 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
CNTLN-202ENST00000380647 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
CNTLN-202ENST00000380647 CHIC1Q5VXU3 224 aa23.72■■□□□ 1.39
CNTLN-202ENST00000380647 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa23.6■■□□□ 1.37
CNTLN-202ENST00000380647 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
CNTLN-202ENST00000380647 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
CNTLN-202ENST00000380647 ITGAEP38570 1179 aa23.47■■□□□ 1.35
CNTLN-202ENST00000380647 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
CNTLN-202ENST00000380647 POLR3GLQ9BT43 218 aa23.37■■□□□ 1.33
CNTLN-202ENST00000380647 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
CNTLN-202ENST00000380647 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
CNTLN-202ENST00000380647 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa23.17■■□□□ 1.3
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CNTLN-202ENST00000380647 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
CNTLN-202ENST00000380647 MYT1LQ9UL68 1186 aa23.03■■□□□ 1.28
CNTLN-202ENST00000380647 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
CNTLN-202ENST00000380647 ANP32CO43423 234 aa22.96■■□□□ 1.27
CNTLN-202ENST00000380647 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
CNTLN-202ENST00000380647 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
CNTLN-202ENST00000380647 BCANQ96GW7 911 aa22.9■■□□□ 1.26
CNTLN-202ENST00000380647 NEUROD1Q13562 356 aa22.82■■□□□ 1.24
CNTLN-202ENST00000380647 TRIM52Q96A61 297 aa22.82■■□□□ 1.24
CNTLN-202ENST00000380647 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
CNTLN-202ENST00000380647 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
CNTLN-202ENST00000380647 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
CNTLN-202ENST00000380647 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
CNTLN-202ENST00000380647 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa22.5■■□□□ 1.19
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CNTLN-202ENST00000380647 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.44■■□□□ 1.18
CNTLN-202ENST00000380647 FKBP8Q14318 412 aa22.38■■□□□ 1.17
CNTLN-202ENST00000380647 NEFMP07197 916 aa22.3■■□□□ 1.16
CNTLN-202ENST00000380647 ABCC9O60706 1549 aa22.29■■□□□ 1.16
CNTLN-202ENST00000380647 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
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CNTLN-202ENST00000380647 TONSLQ96HA7 1378 aa22.23■■□□□ 1.15
CNTLN-202ENST00000380647 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP22.2■■□□□ 1.15
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CNTLN-202ENST00000380647 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
CNTLN-202ENST00000380647 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
CNTLN-202ENST00000380647 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
CNTLN-202ENST00000380647 P3H3Q8IVL6 736 aa22.08■■□□□ 1.12
CNTLN-202ENST00000380647 CCDC136Q96JN2 1154 aa22.06■■□□□ 1.12
CNTLN-202ENST00000380647 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
CNTLN-202ENST00000380647 FAM9BQ8IZU0 186 aa22.03■■□□□ 1.12
CNTLN-202ENST00000380647 BCL11AQ9H165 835 aa22.01■■□□□ 1.11
CNTLN-202ENST00000380647 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
CNTLN-202ENST00000380647 SLC24A1O60721 1099 aa21.96■■□□□ 1.11
CNTLN-202ENST00000380647 MIER1Q8N108 512 aa21.94■■□□□ 1.1
CNTLN-202ENST00000380647 FBLN2P98095 1184 aa21.94■■□□□ 1.1
CNTLN-202ENST00000380647 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
CNTLN-202ENST00000380647 TMC1Q8TDI8 760 aa21.94■■□□□ 1.1
CNTLN-202ENST00000380647 NBR1Q14596 966 aa21.93■■□□□ 1.1
CNTLN-202ENST00000380647 MRS2Q9HD23 443 aa21.88■■□□□ 1.09
CNTLN-202ENST00000380647 ARID3CA6NKF2 412 aa21.87■■□□□ 1.09
CNTLN-202ENST00000380647 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
CNTLN-202ENST00000380647 DDRGK1Q96HY6 314 aa21.8■■□□□ 1.08
CNTLN-202ENST00000380647 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP21.79■■□□□ 1.08
CNTLN-202ENST00000380647 ANP32EQ9BTT0 268 aa21.77■■□□□ 1.08
CNTLN-202ENST00000380647 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
CNTLN-202ENST00000380647 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP21.72■■□□□ 1.07
CNTLN-202ENST00000380647 CLIP1P30622 1438 aa21.7■■□□□ 1.07
CNTLN-202ENST00000380647 BECN1Q14457 450 aa21.7■■□□□ 1.06
CNTLN-202ENST00000380647 SCRIBQ14160 1630 aa21.69■■□□□ 1.06
CNTLN-202ENST00000380647 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa21.68■■□□□ 1.06
CNTLN-202ENST00000380647 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
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CNTLN-202ENST00000380647 CHIC2Q9UKJ5 165 aa21.65■■□□□ 1.06
CNTLN-202ENST00000380647 MTUS2Q5JR59 1369 aa21.64■■□□□ 1.05
CNTLN-202ENST00000380647 CHGAP10645 457 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
CNTLN-202ENST00000380647 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
CNTLN-202ENST00000380647 ARXQ96QS3 562 aa21.6■■□□□ 1.05
CNTLN-202ENST00000380647 MYH16Q9H6N6 1097 aa21.58■■□□□ 1.05
CNTLN-202ENST00000380647 TSPY4P0CV99 314 aa21.58■■□□□ 1.04
CNTLN-202ENST00000380647 TSPY10P0CW01 314 aa21.58■■□□□ 1.04
CNTLN-202ENST00000380647 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
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