Protein–RNA interactions for Protein: P53992

SEC24C, Protein transport protein Sec24C, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24CP53992 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.8 ms