Protein–RNA interactions for Protein: Q14525

KRT33B, Keratin, type I cuticular Ha3-II, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT33BQ14525 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KRT33BQ14525 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KRT33BQ14525 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
KRT33BQ14525 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KRT33BQ14525 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KRT33BQ14525 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KRT33BQ14525 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KRT33BQ14525 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
KRT33BQ14525 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
KRT33BQ14525 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
KRT33BQ14525 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
KRT33BQ14525 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT33BQ14525 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT33BQ14525 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT33BQ14525 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT33BQ14525 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT33BQ14525 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT33BQ14525 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT33BQ14525 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT33BQ14525 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT33BQ14525 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT33BQ14525 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT33BQ14525 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT33BQ14525 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT33BQ14525 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT33BQ14525 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT33BQ14525 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT33BQ14525 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT33BQ14525 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT33BQ14525 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT33BQ14525 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT33BQ14525 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT33BQ14525 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT33BQ14525 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT33BQ14525 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT33BQ14525 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT33BQ14525 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT33BQ14525 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT33BQ14525 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT33BQ14525 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT33BQ14525 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT33BQ14525 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT33BQ14525 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT33BQ14525 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT33BQ14525 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT33BQ14525 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT33BQ14525 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT33BQ14525 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT33BQ14525 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT33BQ14525 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT33BQ14525 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT33BQ14525 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT33BQ14525 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT33BQ14525 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT33BQ14525 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT33BQ14525 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT33BQ14525 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT33BQ14525 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT33BQ14525 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT33BQ14525 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT33BQ14525 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT33BQ14525 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT33BQ14525 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT33BQ14525 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT33BQ14525 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT33BQ14525 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT33BQ14525 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT33BQ14525 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT33BQ14525 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT33BQ14525 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT33BQ14525 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT33BQ14525 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT33BQ14525 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT33BQ14525 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT33BQ14525 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT33BQ14525 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT33BQ14525 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT33BQ14525 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT33BQ14525 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT33BQ14525 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT33BQ14525 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT33BQ14525 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT33BQ14525 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT33BQ14525 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT33BQ14525 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT33BQ14525 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT33BQ14525 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT33BQ14525 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT33BQ14525 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT33BQ14525 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT33BQ14525 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT33BQ14525 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT33BQ14525 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT33BQ14525 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT33BQ14525 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT33BQ14525 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT33BQ14525 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT33BQ14525 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT33BQ14525 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT33BQ14525 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms