RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559589.1

AC100839.1-201, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene AC100839.1, Length 577 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC100839.1-201ENST00000559589 NISCHQ9Y2I1 1504 aa47.22■■■■■ 5.15
AC100839.1-201ENST00000559589 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa41.99■■■■■ 4.31
AC100839.1-201ENST00000559589 ABCC9O60706 1549 aa41.46■■■■■ 4.23
AC100839.1-201ENST00000559589 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa39.68■■■■□ 3.94
AC100839.1-201ENST00000559589 DCAF8L2P0C7V8 631 aa39.6■■■■□ 3.93
AC100839.1-201ENST00000559589 NACADO15069 1562 aa39.59■■■■□ 3.93
AC100839.1-201ENST00000559589 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP39.28■■■■□ 3.88
AC100839.1-201ENST00000559589 MYO15BQ96JP2 1530 aa39.26■■■■□ 3.88
AC100839.1-201ENST00000559589 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa39.01■■■■□ 3.84
AC100839.1-201ENST00000559589 UNC13AQ9UPW8 1703 aa38.76■■■■□ 3.8
AC100839.1-201ENST00000559589 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP38.75■■■■□ 3.79
AC100839.1-201ENST00000559589 BICRAQ9NZM4 1560 aa38.56■■■■□ 3.76
AC100839.1-201ENST00000559589 SCRIBQ14160 1630 aa38.38■■■■□ 3.74
AC100839.1-201ENST00000559589 DNAJC5BQ9UF47 199 aa38.37■■■■□ 3.73
AC100839.1-201ENST00000559589 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa38.04■■■■□ 3.68
AC100839.1-201ENST00000559589 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP37.54■■■■□ 3.6
AC100839.1-201ENST00000559589 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa37.44■■■■□ 3.58
AC100839.1-201ENST00000559589 CECR2Q9BXF3 1484 aa37.26■■■■□ 3.56
AC100839.1-201ENST00000559589 SMARCA4P51532 1647 aa36.67■■■■□ 3.46
AC100839.1-201ENST00000559589 NCAPD3P42695 1498 aa36.58■■■■□ 3.45
AC100839.1-201ENST00000559589 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP36.57■■■■□ 3.45
AC100839.1-201ENST00000559589 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa36.57■■■■□ 3.45
AC100839.1-201ENST00000559589 SMARCA2P51531 1590 aa36.46■■■■□ 3.43
AC100839.1-201ENST00000559589 MROH2BQ7Z745 1585 aa36.42■■■■□ 3.42
AC100839.1-201ENST00000559589 HMGXB3Q12766 1538 aa36.34■■■■□ 3.41
AC100839.1-201ENST00000559589 PEG3Q9GZU2 1588 aa36.3■■■■□ 3.4
AC100839.1-201ENST00000559589 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP36.23■■■■□ 3.39
AC100839.1-201ENST00000559589 WIZO95785 1651 aa35.97■■■■□ 3.35
AC100839.1-201ENST00000559589 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP35.91■■■■□ 3.34
AC100839.1-201ENST00000559589 NESP48681 1621 aa35.82■■■■□ 3.32
AC100839.1-201ENST00000559589 ERCC6Q03468 1493 aa35.72■■■■□ 3.31
AC100839.1-201ENST00000559589 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa35.6■■■■□ 3.29
AC100839.1-201ENST00000559589 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP35.57■■■■□ 3.28
AC100839.1-201ENST00000559589 CADPSQ9ULU8 1353 aa35.51■■■■□ 3.27
AC100839.1-201ENST00000559589 CUX2O14529 1486 aa35.41■■■■□ 3.26
AC100839.1-201ENST00000559589 PDS5BQ9NTI5 1447 aa35.4■■■■□ 3.26
AC100839.1-201ENST00000559589 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa35.3■■■■□ 3.24
AC100839.1-201ENST00000559589 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP35.26■■■■□ 3.24
AC100839.1-201ENST00000559589 CFTRP13569 1480 aa35.24■■■■□ 3.23
AC100839.1-201ENST00000559589 CCDC88BA6NC98 1476 aa35.19■■■■□ 3.22
AC100839.1-201ENST00000559589 FANCD2Q9BXW9 1451 aa35.09■■■■□ 3.21
AC100839.1-201ENST00000559589 MRC2Q9UBG0 1479 aa35.06■■■■□ 3.2
AC100839.1-201ENST00000559589 CEP164Q9UPV0 1460 aa35.05■■■■□ 3.2
AC100839.1-201ENST00000559589 WDR62O43379 1518 aa34.95■■■■□ 3.19
AC100839.1-201ENST00000559589 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP34.84■■■■□ 3.17
AC100839.1-201ENST00000559589 PRDM2Q13029 1718 aa34.81■■■■□ 3.16
AC100839.1-201ENST00000559589 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP34.78■■■■□ 3.16
AC100839.1-201ENST00000559589 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa34.69■■■■□ 3.14
AC100839.1-201ENST00000559589 TOPBP1Q92547 1522 aa34.5■■■■□ 3.11
AC100839.1-201ENST00000559589 ABCC8Q09428 1581 aa34.43■■■■□ 3.1
AC100839.1-201ENST00000559589 DNMBPQ6XZF7 1577 aa34.41■■■■□ 3.1
AC100839.1-201ENST00000559589 IFT140Q96RY7 1462 aa34.33■■■■□ 3.09
AC100839.1-201ENST00000559589 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP34.26■■■■□ 3.08
AC100839.1-201ENST00000559589 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP34.2■■■■□ 3.07
AC100839.1-201ENST00000559589 CUX1P39880 1505 aa34.17■■■■□ 3.06
AC100839.1-201ENST00000559589 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP34.13■■■■□ 3.05
AC100839.1-201ENST00000559589 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa34.09■■■■□ 3.05
AC100839.1-201ENST00000559589 FGD5Q6ZNL6 1462 aa34.08■■■■□ 3.05
AC100839.1-201ENST00000559589 SOGA1O94964 1423 aa34.06■■■■□ 3.04
AC100839.1-201ENST00000559589 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP34.04■■■■□ 3.04
AC100839.1-201ENST00000559589 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP34.03■■■■□ 3.04
AC100839.1-201ENST00000559589 OSCARQ8IYS5 282 aa33.94■■■■□ 3.02
AC100839.1-201ENST00000559589 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP33.94■■■■□ 3.02
AC100839.1-201ENST00000559589 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP33.85■■■■□ 3.01
AC100839.1-201ENST00000559589 SYNJ1O43426 1573 aa33.77■■■■□ 3
AC100839.1-201ENST00000559589 WDR97A6NE52 1622 aa33.77■■■■□ 3
AC100839.1-201ENST00000559589 TOP2BQ02880 1626 aa33.76■■■■□ 3
AC100839.1-201ENST00000559589 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa33.74■■■□□ 2.99
AC100839.1-201ENST00000559589 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa33.73■■■□□ 2.99
AC100839.1-201ENST00000559589 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa33.69■■■□□ 2.98
AC100839.1-201ENST00000559589 GRIN2BQ13224 1484 aa33.68■■■□□ 2.98
AC100839.1-201ENST00000559589 FBLN2P98095 1184 aa33.66■■■□□ 2.98
AC100839.1-201ENST00000559589 GAPVD1Q14C86 1478 aa33.65■■■□□ 2.98
AC100839.1-201ENST00000559589 CHD1O14646 1710 aa33.63■■■□□ 2.97
AC100839.1-201ENST00000559589 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP33.6■■■□□ 2.97
AC100839.1-201ENST00000559589 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa33.59■■■□□ 2.97
AC100839.1-201ENST00000559589 PBRM1Q86U86 1689 aa33.52■■■□□ 2.96
AC100839.1-201ENST00000559589 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP33.51■■■□□ 2.95
AC100839.1-201ENST00000559589 SYNJ2O15056 1496 aa33.48■■■□□ 2.95
AC100839.1-201ENST00000559589 TRIM41Q8WV44 630 aa33.45■■■□□ 2.95
AC100839.1-201ENST00000559589 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa33.39■■■□□ 2.94
AC100839.1-201ENST00000559589 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa33.39■■■□□ 2.94
AC100839.1-201ENST00000559589 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa33.39■■■□□ 2.94
AC100839.1-201ENST00000559589 ARHGEF11O15085 1522 aa33.38■■■□□ 2.93
AC100839.1-201ENST00000559589 CLASP1Q7Z460 1538 aa33.32■■■□□ 2.92
AC100839.1-201ENST00000559589 ADAMTS12P58397 1594 aa33.3■■■□□ 2.92
AC100839.1-201ENST00000559589 ERICH3Q5RHP9 1530 aa33.29■■■□□ 2.92
AC100839.1-201ENST00000559589 FHAD1B1AJZ9 1412 aa33.25■■■□□ 2.91
AC100839.1-201ENST00000559589 GRIN2AQ12879 1464 aa33.25■■■□□ 2.91
AC100839.1-201ENST00000559589 KIF27Q86VH2 1401 aa33.14■■■□□ 2.9
AC100839.1-201ENST00000559589 CYB5RLQ6IPT4 315 aa33.13■■■□□ 2.89
AC100839.1-201ENST00000559589 ARAP1Q96P48 1450 aa33.12■■■□□ 2.89
AC100839.1-201ENST00000559589 NUP160Q12769 1436 aa33.12■■■□□ 2.89
AC100839.1-201ENST00000559589 CEP170Q5SW79 1584 aa33.1■■■□□ 2.89
AC100839.1-201ENST00000559589 IGF1RP08069 1367 aa33.09■■■□□ 2.89
AC100839.1-201ENST00000559589 CUL7Q14999 1698 aa32.9■■■□□ 2.86
AC100839.1-201ENST00000559589 ERCC6L2Q5T890 1561 aa32.88■■■□□ 2.85
AC100839.1-201ENST00000559589 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa32.86■■■□□ 2.85
AC100839.1-201ENST00000559589 SHROOM2Q13796 1616 aa32.86■■■□□ 2.85
AC100839.1-201ENST00000559589 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa32.84■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.4 ms