Protein–RNA interactions for Protein: U3KQE9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQE9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
U3KQE9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
U3KQE9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
U3KQE9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
U3KQE9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
U3KQE9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
U3KQE9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
U3KQE9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
U3KQE9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
U3KQE9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
U3KQE9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
U3KQE9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
U3KQE9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
U3KQE9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
U3KQE9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
U3KQE9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
U3KQE9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
U3KQE9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
U3KQE9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
U3KQE9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
U3KQE9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
U3KQE9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
U3KQE9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
U3KQE9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
U3KQE9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
U3KQE9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
U3KQE9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
U3KQE9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
U3KQE9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
U3KQE9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
U3KQE9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
U3KQE9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
U3KQE9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
U3KQE9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
U3KQE9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
U3KQE9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
U3KQE9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
U3KQE9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
U3KQE9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
U3KQE9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
U3KQE9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
U3KQE9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
U3KQE9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
U3KQE9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
U3KQE9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
U3KQE9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
U3KQE9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
U3KQE9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
U3KQE9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
U3KQE9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
U3KQE9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
U3KQE9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
U3KQE9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
U3KQE9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
U3KQE9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
U3KQE9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
U3KQE9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
U3KQE9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
U3KQE9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
U3KQE9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
U3KQE9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
U3KQE9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
U3KQE9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
U3KQE9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
U3KQE9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
U3KQE9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
U3KQE9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
U3KQE9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
U3KQE9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
U3KQE9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
U3KQE9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
U3KQE9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
U3KQE9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
U3KQE9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
U3KQE9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
U3KQE9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
U3KQE9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
U3KQE9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
U3KQE9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
U3KQE9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
U3KQE9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
U3KQE9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
U3KQE9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
U3KQE9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
U3KQE9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
U3KQE9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
U3KQE9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
U3KQE9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
U3KQE9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
U3KQE9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
U3KQE9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
U3KQE9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
U3KQE9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
U3KQE9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
U3KQE9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
U3KQE9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
U3KQE9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
U3KQE9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
U3KQE9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
U3KQE9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms