Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6N6

LAMC3, Laminin subunit gamma-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC3Q9Y6N6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC45.16■■■■■ 4.82
LAMC3Q9Y6N6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC45.16■■■■■ 4.82
LAMC3Q9Y6N6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC45.15■■■■■ 4.82
LAMC3Q9Y6N6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.15■■■■■ 4.82
LAMC3Q9Y6N6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.15■■■■■ 4.82
LAMC3Q9Y6N6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC45.14■■■■■ 4.82
LAMC3Q9Y6N6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.14■■■■■ 4.82
LAMC3Q9Y6N6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC45.14■■■■■ 4.82
LAMC3Q9Y6N6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC45.13■■■■■ 4.82
LAMC3Q9Y6N6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.13■■■■■ 4.82
LAMC3Q9Y6N6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.12■■■■■ 4.81
LAMC3Q9Y6N6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.12■■■■■ 4.81
LAMC3Q9Y6N6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC45.12■■■■■ 4.81
LAMC3Q9Y6N6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.11■■■■■ 4.81
LAMC3Q9Y6N6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.09■■■■■ 4.81
LAMC3Q9Y6N6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC45.09■■■■■ 4.81
LAMC3Q9Y6N6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC45.08■■■■■ 4.81
LAMC3Q9Y6N6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC45.08■■■■■ 4.81
LAMC3Q9Y6N6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC45.08■■■■■ 4.81
LAMC3Q9Y6N6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC45.07■■■■■ 4.81
LAMC3Q9Y6N6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC45.07■■■■■ 4.8
LAMC3Q9Y6N6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC45.07■■■■■ 4.8
LAMC3Q9Y6N6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC45.07■■■■■ 4.8
LAMC3Q9Y6N6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.06■■■■■ 4.8
LAMC3Q9Y6N6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.05■■■■■ 4.8
LAMC3Q9Y6N6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.05■■■■■ 4.8
LAMC3Q9Y6N6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.03■■■■■ 4.8
LAMC3Q9Y6N6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC45.03■■■■■ 4.8
LAMC3Q9Y6N6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC45.03■■■■■ 4.8
LAMC3Q9Y6N6 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.01■■■■■ 4.8
LAMC3Q9Y6N6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.01■■■■■ 4.8
LAMC3Q9Y6N6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC45■■■■■ 4.79
LAMC3Q9Y6N6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC44.99■■■■■ 4.79
LAMC3Q9Y6N6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.99■■■■■ 4.79
LAMC3Q9Y6N6 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.98■■■■■ 4.79
LAMC3Q9Y6N6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC44.98■■■■■ 4.79
LAMC3Q9Y6N6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.98■■■■■ 4.79
LAMC3Q9Y6N6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.98■■■■■ 4.79
LAMC3Q9Y6N6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC44.98■■■■■ 4.79
LAMC3Q9Y6N6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC44.98■■■■■ 4.79
LAMC3Q9Y6N6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC44.98■■■■■ 4.79
LAMC3Q9Y6N6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC44.98■■■■■ 4.79
LAMC3Q9Y6N6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC44.97■■■■■ 4.79
LAMC3Q9Y6N6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC44.97■■■■■ 4.79
LAMC3Q9Y6N6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC44.96■■■■■ 4.79
LAMC3Q9Y6N6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.96■■■■■ 4.79
LAMC3Q9Y6N6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC44.94■■■■■ 4.79
LAMC3Q9Y6N6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC44.94■■■■■ 4.79
LAMC3Q9Y6N6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC44.94■■■■■ 4.78
LAMC3Q9Y6N6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC44.94■■■■■ 4.78
LAMC3Q9Y6N6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.93■■■■■ 4.78
LAMC3Q9Y6N6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.92■■■■■ 4.78
LAMC3Q9Y6N6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.92■■■■■ 4.78
LAMC3Q9Y6N6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.92■■■■■ 4.78
LAMC3Q9Y6N6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC44.91■■■■■ 4.78
LAMC3Q9Y6N6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC44.91■■■■■ 4.78
LAMC3Q9Y6N6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC44.91■■■■■ 4.78
LAMC3Q9Y6N6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC44.9■■■■■ 4.78
LAMC3Q9Y6N6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC44.9■■■■■ 4.78
LAMC3Q9Y6N6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC44.89■■■■■ 4.78
LAMC3Q9Y6N6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.89■■■■■ 4.78
LAMC3Q9Y6N6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.89■■■■■ 4.78
LAMC3Q9Y6N6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC44.88■■■■■ 4.78
LAMC3Q9Y6N6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC44.88■■■■■ 4.77
LAMC3Q9Y6N6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC44.87■■■■■ 4.77
LAMC3Q9Y6N6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC44.86■■■■■ 4.77
LAMC3Q9Y6N6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.86■■■■■ 4.77
LAMC3Q9Y6N6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC44.86■■■■■ 4.77
LAMC3Q9Y6N6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.86■■■■■ 4.77
LAMC3Q9Y6N6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.85■■■■■ 4.77
LAMC3Q9Y6N6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC44.85■■■■■ 4.77
LAMC3Q9Y6N6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC44.85■■■■■ 4.77
LAMC3Q9Y6N6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.84■■■■■ 4.77
LAMC3Q9Y6N6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.84■■■■■ 4.77
LAMC3Q9Y6N6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC44.84■■■■■ 4.77
LAMC3Q9Y6N6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC44.84■■■■■ 4.77
LAMC3Q9Y6N6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.84■■■■■ 4.77
LAMC3Q9Y6N6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.84■■■■■ 4.77
LAMC3Q9Y6N6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.83■■■■■ 4.77
LAMC3Q9Y6N6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC44.83■■■■■ 4.77
LAMC3Q9Y6N6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC44.83■■■■■ 4.77
LAMC3Q9Y6N6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC44.82■■■■■ 4.77
LAMC3Q9Y6N6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.82■■■■■ 4.76
LAMC3Q9Y6N6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC44.81■■■■■ 4.76
LAMC3Q9Y6N6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.8■■■■■ 4.76
LAMC3Q9Y6N6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC44.8■■■■■ 4.76
LAMC3Q9Y6N6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.8■■■■■ 4.76
LAMC3Q9Y6N6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.8■■■■■ 4.76
LAMC3Q9Y6N6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.8■■■■■ 4.76
LAMC3Q9Y6N6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC44.79■■■■■ 4.76
LAMC3Q9Y6N6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC44.78■■■■■ 4.76
LAMC3Q9Y6N6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.78■■■■■ 4.76
LAMC3Q9Y6N6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC44.77■■■■■ 4.76
LAMC3Q9Y6N6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC44.76■■■■■ 4.76
LAMC3Q9Y6N6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC44.76■■■■■ 4.76
LAMC3Q9Y6N6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.75■■■■■ 4.75
LAMC3Q9Y6N6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC44.74■■■■■ 4.75
LAMC3Q9Y6N6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC44.74■■■■■ 4.75
LAMC3Q9Y6N6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC44.73■■■■■ 4.75
LAMC3Q9Y6N6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.73■■■■■ 4.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms