Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6H8

GJA3, Gap junction alpha-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA3Q9Y6H8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
GJA3Q9Y6H8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
GJA3Q9Y6H8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
GJA3Q9Y6H8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
GJA3Q9Y6H8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
GJA3Q9Y6H8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
GJA3Q9Y6H8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
GJA3Q9Y6H8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
GJA3Q9Y6H8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC31.12■■■□□ 2.57
GJA3Q9Y6H8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
GJA3Q9Y6H8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
GJA3Q9Y6H8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
GJA3Q9Y6H8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
GJA3Q9Y6H8 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.1■■■□□ 2.57
GJA3Q9Y6H8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
GJA3Q9Y6H8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
GJA3Q9Y6H8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
GJA3Q9Y6H8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
GJA3Q9Y6H8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
GJA3Q9Y6H8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
GJA3Q9Y6H8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
GJA3Q9Y6H8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
GJA3Q9Y6H8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC31.07■■■□□ 2.56
GJA3Q9Y6H8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
GJA3Q9Y6H8 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
GJA3Q9Y6H8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
GJA3Q9Y6H8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
GJA3Q9Y6H8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
GJA3Q9Y6H8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
GJA3Q9Y6H8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
GJA3Q9Y6H8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
GJA3Q9Y6H8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
GJA3Q9Y6H8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
GJA3Q9Y6H8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
GJA3Q9Y6H8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
GJA3Q9Y6H8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
GJA3Q9Y6H8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC31.03■■■□□ 2.56
GJA3Q9Y6H8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
GJA3Q9Y6H8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
GJA3Q9Y6H8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
GJA3Q9Y6H8 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
GJA3Q9Y6H8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
GJA3Q9Y6H8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
GJA3Q9Y6H8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
GJA3Q9Y6H8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
GJA3Q9Y6H8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
GJA3Q9Y6H8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
GJA3Q9Y6H8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
GJA3Q9Y6H8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
GJA3Q9Y6H8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
GJA3Q9Y6H8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
GJA3Q9Y6H8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
GJA3Q9Y6H8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
GJA3Q9Y6H8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
GJA3Q9Y6H8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
GJA3Q9Y6H8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
GJA3Q9Y6H8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
GJA3Q9Y6H8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
GJA3Q9Y6H8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
GJA3Q9Y6H8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
GJA3Q9Y6H8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
GJA3Q9Y6H8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
GJA3Q9Y6H8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
GJA3Q9Y6H8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
GJA3Q9Y6H8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
GJA3Q9Y6H8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
GJA3Q9Y6H8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
GJA3Q9Y6H8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
GJA3Q9Y6H8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
GJA3Q9Y6H8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
GJA3Q9Y6H8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
GJA3Q9Y6H8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
GJA3Q9Y6H8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
GJA3Q9Y6H8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
GJA3Q9Y6H8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
GJA3Q9Y6H8 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
GJA3Q9Y6H8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
GJA3Q9Y6H8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
GJA3Q9Y6H8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
GJA3Q9Y6H8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
GJA3Q9Y6H8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
GJA3Q9Y6H8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
GJA3Q9Y6H8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
GJA3Q9Y6H8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
GJA3Q9Y6H8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
GJA3Q9Y6H8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
GJA3Q9Y6H8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
GJA3Q9Y6H8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
GJA3Q9Y6H8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
GJA3Q9Y6H8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
GJA3Q9Y6H8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
GJA3Q9Y6H8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
GJA3Q9Y6H8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
GJA3Q9Y6H8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
GJA3Q9Y6H8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
GJA3Q9Y6H8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
GJA3Q9Y6H8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
GJA3Q9Y6H8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
GJA3Q9Y6H8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
GJA3Q9Y6H8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.1 ms