Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6G9

DYNC1LI1, Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1LI1Q9Y6G9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DYNC1LI1Q9Y6G9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DYNC1LI1Q9Y6G9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
DYNC1LI1Q9Y6G9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DYNC1LI1Q9Y6G9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
DYNC1LI1Q9Y6G9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
DYNC1LI1Q9Y6G9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
DYNC1LI1Q9Y6G9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
DYNC1LI1Q9Y6G9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
DYNC1LI1Q9Y6G9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DYNC1LI1Q9Y6G9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DYNC1LI1Q9Y6G9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DYNC1LI1Q9Y6G9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DYNC1LI1Q9Y6G9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DYNC1LI1Q9Y6G9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DYNC1LI1Q9Y6G9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DYNC1LI1Q9Y6G9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DYNC1LI1Q9Y6G9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
DYNC1LI1Q9Y6G9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DYNC1LI1Q9Y6G9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DYNC1LI1Q9Y6G9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DYNC1LI1Q9Y6G9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DYNC1LI1Q9Y6G9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DYNC1LI1Q9Y6G9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
DYNC1LI1Q9Y6G9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DYNC1LI1Q9Y6G9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DYNC1LI1Q9Y6G9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
DYNC1LI1Q9Y6G9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
DYNC1LI1Q9Y6G9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
DYNC1LI1Q9Y6G9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
DYNC1LI1Q9Y6G9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
DYNC1LI1Q9Y6G9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
DYNC1LI1Q9Y6G9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
DYNC1LI1Q9Y6G9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
DYNC1LI1Q9Y6G9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
DYNC1LI1Q9Y6G9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
DYNC1LI1Q9Y6G9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
DYNC1LI1Q9Y6G9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DYNC1LI1Q9Y6G9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DYNC1LI1Q9Y6G9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DYNC1LI1Q9Y6G9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DYNC1LI1Q9Y6G9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DYNC1LI1Q9Y6G9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DYNC1LI1Q9Y6G9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DYNC1LI1Q9Y6G9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DYNC1LI1Q9Y6G9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DYNC1LI1Q9Y6G9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DYNC1LI1Q9Y6G9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DYNC1LI1Q9Y6G9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DYNC1LI1Q9Y6G9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DYNC1LI1Q9Y6G9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DYNC1LI1Q9Y6G9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DYNC1LI1Q9Y6G9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DYNC1LI1Q9Y6G9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
DYNC1LI1Q9Y6G9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DYNC1LI1Q9Y6G9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DYNC1LI1Q9Y6G9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DYNC1LI1Q9Y6G9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DYNC1LI1Q9Y6G9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DYNC1LI1Q9Y6G9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DYNC1LI1Q9Y6G9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DYNC1LI1Q9Y6G9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DYNC1LI1Q9Y6G9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DYNC1LI1Q9Y6G9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DYNC1LI1Q9Y6G9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DYNC1LI1Q9Y6G9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DYNC1LI1Q9Y6G9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DYNC1LI1Q9Y6G9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DYNC1LI1Q9Y6G9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DYNC1LI1Q9Y6G9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DYNC1LI1Q9Y6G9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DYNC1LI1Q9Y6G9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DYNC1LI1Q9Y6G9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DYNC1LI1Q9Y6G9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DYNC1LI1Q9Y6G9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DYNC1LI1Q9Y6G9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
DYNC1LI1Q9Y6G9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DYNC1LI1Q9Y6G9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DYNC1LI1Q9Y6G9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DYNC1LI1Q9Y6G9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DYNC1LI1Q9Y6G9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DYNC1LI1Q9Y6G9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DYNC1LI1Q9Y6G9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DYNC1LI1Q9Y6G9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DYNC1LI1Q9Y6G9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
DYNC1LI1Q9Y6G9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DYNC1LI1Q9Y6G9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
DYNC1LI1Q9Y6G9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DYNC1LI1Q9Y6G9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DYNC1LI1Q9Y6G9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DYNC1LI1Q9Y6G9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
DYNC1LI1Q9Y6G9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DYNC1LI1Q9Y6G9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
DYNC1LI1Q9Y6G9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DYNC1LI1Q9Y6G9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DYNC1LI1Q9Y6G9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms