Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E1

WASHC2C, WASH complex subunit 2C, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC2CQ9Y4E1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
WASHC2CQ9Y4E1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
WASHC2CQ9Y4E1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
WASHC2CQ9Y4E1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
WASHC2CQ9Y4E1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC37.93■■■■□ 3.66
WASHC2CQ9Y4E1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
WASHC2CQ9Y4E1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC37.92■■■■□ 3.66
WASHC2CQ9Y4E1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
WASHC2CQ9Y4E1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC37.91■■■■□ 3.66
WASHC2CQ9Y4E1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
WASHC2CQ9Y4E1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
WASHC2CQ9Y4E1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC37.91■■■■□ 3.66
WASHC2CQ9Y4E1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
WASHC2CQ9Y4E1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
WASHC2CQ9Y4E1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
WASHC2CQ9Y4E1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
WASHC2CQ9Y4E1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
WASHC2CQ9Y4E1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
WASHC2CQ9Y4E1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
WASHC2CQ9Y4E1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
WASHC2CQ9Y4E1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
WASHC2CQ9Y4E1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC37.88■■■■□ 3.66
WASHC2CQ9Y4E1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC37.86■■■■□ 3.65
WASHC2CQ9Y4E1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
WASHC2CQ9Y4E1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
WASHC2CQ9Y4E1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
WASHC2CQ9Y4E1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC37.86■■■■□ 3.65
WASHC2CQ9Y4E1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
WASHC2CQ9Y4E1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
WASHC2CQ9Y4E1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
WASHC2CQ9Y4E1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
WASHC2CQ9Y4E1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
WASHC2CQ9Y4E1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
WASHC2CQ9Y4E1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
WASHC2CQ9Y4E1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
WASHC2CQ9Y4E1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
WASHC2CQ9Y4E1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
WASHC2CQ9Y4E1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC37.81■■■■□ 3.64
WASHC2CQ9Y4E1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
WASHC2CQ9Y4E1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
WASHC2CQ9Y4E1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC37.79■■■■□ 3.64
WASHC2CQ9Y4E1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
WASHC2CQ9Y4E1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
WASHC2CQ9Y4E1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
WASHC2CQ9Y4E1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
WASHC2CQ9Y4E1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
WASHC2CQ9Y4E1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
WASHC2CQ9Y4E1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.76■■■■□ 3.64
WASHC2CQ9Y4E1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
WASHC2CQ9Y4E1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC37.75■■■■□ 3.63
WASHC2CQ9Y4E1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
WASHC2CQ9Y4E1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
WASHC2CQ9Y4E1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
WASHC2CQ9Y4E1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
WASHC2CQ9Y4E1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
WASHC2CQ9Y4E1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
WASHC2CQ9Y4E1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
WASHC2CQ9Y4E1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC37.73■■■■□ 3.63
WASHC2CQ9Y4E1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
WASHC2CQ9Y4E1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC37.72■■■■□ 3.63
WASHC2CQ9Y4E1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
WASHC2CQ9Y4E1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
WASHC2CQ9Y4E1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
WASHC2CQ9Y4E1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
WASHC2CQ9Y4E1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
WASHC2CQ9Y4E1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
WASHC2CQ9Y4E1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
WASHC2CQ9Y4E1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.62
WASHC2CQ9Y4E1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
WASHC2CQ9Y4E1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
WASHC2CQ9Y4E1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
WASHC2CQ9Y4E1 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
WASHC2CQ9Y4E1 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
WASHC2CQ9Y4E1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
WASHC2CQ9Y4E1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
WASHC2CQ9Y4E1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC37.66■■■■□ 3.62
WASHC2CQ9Y4E1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
WASHC2CQ9Y4E1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
WASHC2CQ9Y4E1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC37.64■■■■□ 3.62
WASHC2CQ9Y4E1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC37.63■■■■□ 3.62
WASHC2CQ9Y4E1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
WASHC2CQ9Y4E1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
WASHC2CQ9Y4E1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
WASHC2CQ9Y4E1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
WASHC2CQ9Y4E1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC37.62■■■■□ 3.61
WASHC2CQ9Y4E1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.62■■■■□ 3.61
WASHC2CQ9Y4E1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
WASHC2CQ9Y4E1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
WASHC2CQ9Y4E1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
WASHC2CQ9Y4E1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
WASHC2CQ9Y4E1 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
WASHC2CQ9Y4E1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
WASHC2CQ9Y4E1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC37.61■■■■□ 3.61
WASHC2CQ9Y4E1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC37.61■■■■□ 3.61
WASHC2CQ9Y4E1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
WASHC2CQ9Y4E1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
WASHC2CQ9Y4E1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
WASHC2CQ9Y4E1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
WASHC2CQ9Y4E1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
WASHC2CQ9Y4E1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.2 ms