Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B4

RAD54L2, Helicase ARIP4, humanhuman

Predictions only

Length 1,467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54L2Q9Y4B4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.37■■■■■ 4.53
RAD54L2Q9Y4B4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
RAD54L2Q9Y4B4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
RAD54L2Q9Y4B4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
RAD54L2Q9Y4B4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC43.34■■■■■ 4.53
RAD54L2Q9Y4B4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC43.34■■■■■ 4.53
RAD54L2Q9Y4B4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
RAD54L2Q9Y4B4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
RAD54L2Q9Y4B4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
RAD54L2Q9Y4B4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
RAD54L2Q9Y4B4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
RAD54L2Q9Y4B4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.53
RAD54L2Q9Y4B4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC43.32■■■■■ 4.53
RAD54L2Q9Y4B4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.53
RAD54L2Q9Y4B4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC43.32■■■■■ 4.52
RAD54L2Q9Y4B4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC43.32■■■■■ 4.52
RAD54L2Q9Y4B4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.52
RAD54L2Q9Y4B4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC43.32■■■■■ 4.52
RAD54L2Q9Y4B4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.31■■■■■ 4.52
RAD54L2Q9Y4B4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.31■■■■■ 4.52
RAD54L2Q9Y4B4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC43.31■■■■■ 4.52
RAD54L2Q9Y4B4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC43.31■■■■■ 4.52
RAD54L2Q9Y4B4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
RAD54L2Q9Y4B4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.27■■■■■ 4.52
RAD54L2Q9Y4B4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.27■■■■■ 4.52
RAD54L2Q9Y4B4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.26■■■■■ 4.52
RAD54L2Q9Y4B4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.26■■■■■ 4.52
RAD54L2Q9Y4B4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC43.26■■■■■ 4.52
RAD54L2Q9Y4B4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.26■■■■■ 4.52
RAD54L2Q9Y4B4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
RAD54L2Q9Y4B4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
RAD54L2Q9Y4B4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
RAD54L2Q9Y4B4 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC43.23■■■■■ 4.51
RAD54L2Q9Y4B4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
RAD54L2Q9Y4B4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
RAD54L2Q9Y4B4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC43.22■■■■■ 4.51
RAD54L2Q9Y4B4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC43.22■■■■■ 4.51
RAD54L2Q9Y4B4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC43.22■■■■■ 4.51
RAD54L2Q9Y4B4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC43.22■■■■■ 4.51
RAD54L2Q9Y4B4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.21■■■■■ 4.51
RAD54L2Q9Y4B4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.21■■■■■ 4.51
RAD54L2Q9Y4B4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.2■■■■■ 4.51
RAD54L2Q9Y4B4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.19■■■■■ 4.51
RAD54L2Q9Y4B4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.5
RAD54L2Q9Y4B4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.5
RAD54L2Q9Y4B4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC43.18■■■■■ 4.5
RAD54L2Q9Y4B4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.18■■■■■ 4.5
RAD54L2Q9Y4B4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC43.18■■■■■ 4.5
RAD54L2Q9Y4B4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC43.18■■■■■ 4.5
RAD54L2Q9Y4B4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC43.18■■■■■ 4.5
RAD54L2Q9Y4B4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC43.15■■■■■ 4.5
RAD54L2Q9Y4B4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
RAD54L2Q9Y4B4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC43.14■■■■■ 4.5
RAD54L2Q9Y4B4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
RAD54L2Q9Y4B4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.49
RAD54L2Q9Y4B4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.49
RAD54L2Q9Y4B4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
RAD54L2Q9Y4B4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
RAD54L2Q9Y4B4 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC43.1■■■■■ 4.49
RAD54L2Q9Y4B4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC43.1■■■■■ 4.49
RAD54L2Q9Y4B4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC43.1■■■■■ 4.49
RAD54L2Q9Y4B4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC43.1■■■■■ 4.49
RAD54L2Q9Y4B4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.1■■■■■ 4.49
RAD54L2Q9Y4B4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.1■■■■■ 4.49
RAD54L2Q9Y4B4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
RAD54L2Q9Y4B4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC43.09■■■■■ 4.49
RAD54L2Q9Y4B4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.08■■■■■ 4.49
RAD54L2Q9Y4B4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC43.08■■■■■ 4.49
RAD54L2Q9Y4B4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC43.08■■■■■ 4.49
RAD54L2Q9Y4B4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC43.07■■■■■ 4.49
RAD54L2Q9Y4B4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC43.07■■■■■ 4.49
RAD54L2Q9Y4B4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.48
RAD54L2Q9Y4B4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.48
RAD54L2Q9Y4B4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC43.06■■■■■ 4.48
RAD54L2Q9Y4B4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.05■■■■■ 4.48
RAD54L2Q9Y4B4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC43.05■■■■■ 4.48
RAD54L2Q9Y4B4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC43.02■■■■■ 4.48
RAD54L2Q9Y4B4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
RAD54L2Q9Y4B4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
RAD54L2Q9Y4B4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC43.01■■■■■ 4.48
RAD54L2Q9Y4B4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.01■■■■■ 4.48
RAD54L2Q9Y4B4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
RAD54L2Q9Y4B4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC43■■■■■ 4.47
RAD54L2Q9Y4B4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC43■■■■■ 4.47
RAD54L2Q9Y4B4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4.47
RAD54L2Q9Y4B4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
RAD54L2Q9Y4B4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC42.96■■■■■ 4.47
RAD54L2Q9Y4B4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.96■■■■■ 4.47
RAD54L2Q9Y4B4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC42.95■■■■■ 4.47
RAD54L2Q9Y4B4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
RAD54L2Q9Y4B4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.47
RAD54L2Q9Y4B4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.47
RAD54L2Q9Y4B4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC42.94■■■■■ 4.46
RAD54L2Q9Y4B4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
RAD54L2Q9Y4B4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
RAD54L2Q9Y4B4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC42.93■■■■■ 4.46
RAD54L2Q9Y4B4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC42.93■■■■■ 4.46
RAD54L2Q9Y4B4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
RAD54L2Q9Y4B4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC42.91■■■■■ 4.46
RAD54L2Q9Y4B4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC42.91■■■■■ 4.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms