Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y446

PKP3, Plakophilin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3Q9Y446 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PKP3Q9Y446 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PKP3Q9Y446 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PKP3Q9Y446 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PKP3Q9Y446 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PKP3Q9Y446 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PKP3Q9Y446 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PKP3Q9Y446 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PKP3Q9Y446 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PKP3Q9Y446 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PKP3Q9Y446 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PKP3Q9Y446 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PKP3Q9Y446 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PKP3Q9Y446 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PKP3Q9Y446 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PKP3Q9Y446 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PKP3Q9Y446 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PKP3Q9Y446 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PKP3Q9Y446 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PKP3Q9Y446 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PKP3Q9Y446 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PKP3Q9Y446 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PKP3Q9Y446 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PKP3Q9Y446 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PKP3Q9Y446 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PKP3Q9Y446 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PKP3Q9Y446 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PKP3Q9Y446 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PKP3Q9Y446 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PKP3Q9Y446 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PKP3Q9Y446 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PKP3Q9Y446 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PKP3Q9Y446 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PKP3Q9Y446 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PKP3Q9Y446 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PKP3Q9Y446 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PKP3Q9Y446 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PKP3Q9Y446 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PKP3Q9Y446 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PKP3Q9Y446 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PKP3Q9Y446 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PKP3Q9Y446 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PKP3Q9Y446 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PKP3Q9Y446 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PKP3Q9Y446 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PKP3Q9Y446 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PKP3Q9Y446 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PKP3Q9Y446 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PKP3Q9Y446 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PKP3Q9Y446 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PKP3Q9Y446 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PKP3Q9Y446 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PKP3Q9Y446 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PKP3Q9Y446 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PKP3Q9Y446 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PKP3Q9Y446 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PKP3Q9Y446 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PKP3Q9Y446 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PKP3Q9Y446 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PKP3Q9Y446 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PKP3Q9Y446 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PKP3Q9Y446 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PKP3Q9Y446 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PKP3Q9Y446 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PKP3Q9Y446 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PKP3Q9Y446 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PKP3Q9Y446 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PKP3Q9Y446 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PKP3Q9Y446 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PKP3Q9Y446 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PKP3Q9Y446 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PKP3Q9Y446 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PKP3Q9Y446 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PKP3Q9Y446 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PKP3Q9Y446 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PKP3Q9Y446 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PKP3Q9Y446 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PKP3Q9Y446 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PKP3Q9Y446 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PKP3Q9Y446 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PKP3Q9Y446 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PKP3Q9Y446 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PKP3Q9Y446 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PKP3Q9Y446 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PKP3Q9Y446 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PKP3Q9Y446 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PKP3Q9Y446 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PKP3Q9Y446 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PKP3Q9Y446 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PKP3Q9Y446 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PKP3Q9Y446 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PKP3Q9Y446 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PKP3Q9Y446 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PKP3Q9Y446 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PKP3Q9Y446 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PKP3Q9Y446 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PKP3Q9Y446 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PKP3Q9Y446 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PKP3Q9Y446 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PKP3Q9Y446 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms