Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I7

PIKFYVE, 1-phosphatidylinositol 3-phosphate 5-kinase, humanhuman

Predictions only

Length 2,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIKFYVEQ9Y2I7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PIKFYVEQ9Y2I7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PIKFYVEQ9Y2I7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PIKFYVEQ9Y2I7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PIKFYVEQ9Y2I7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PIKFYVEQ9Y2I7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PIKFYVEQ9Y2I7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PIKFYVEQ9Y2I7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PIKFYVEQ9Y2I7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PIKFYVEQ9Y2I7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PIKFYVEQ9Y2I7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PIKFYVEQ9Y2I7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PIKFYVEQ9Y2I7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PIKFYVEQ9Y2I7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PIKFYVEQ9Y2I7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PIKFYVEQ9Y2I7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PIKFYVEQ9Y2I7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PIKFYVEQ9Y2I7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PIKFYVEQ9Y2I7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PIKFYVEQ9Y2I7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PIKFYVEQ9Y2I7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PIKFYVEQ9Y2I7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PIKFYVEQ9Y2I7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PIKFYVEQ9Y2I7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PIKFYVEQ9Y2I7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PIKFYVEQ9Y2I7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PIKFYVEQ9Y2I7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PIKFYVEQ9Y2I7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PIKFYVEQ9Y2I7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PIKFYVEQ9Y2I7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PIKFYVEQ9Y2I7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PIKFYVEQ9Y2I7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PIKFYVEQ9Y2I7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PIKFYVEQ9Y2I7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PIKFYVEQ9Y2I7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PIKFYVEQ9Y2I7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PIKFYVEQ9Y2I7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PIKFYVEQ9Y2I7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PIKFYVEQ9Y2I7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PIKFYVEQ9Y2I7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PIKFYVEQ9Y2I7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PIKFYVEQ9Y2I7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PIKFYVEQ9Y2I7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PIKFYVEQ9Y2I7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PIKFYVEQ9Y2I7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PIKFYVEQ9Y2I7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PIKFYVEQ9Y2I7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PIKFYVEQ9Y2I7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PIKFYVEQ9Y2I7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PIKFYVEQ9Y2I7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PIKFYVEQ9Y2I7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PIKFYVEQ9Y2I7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PIKFYVEQ9Y2I7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PIKFYVEQ9Y2I7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PIKFYVEQ9Y2I7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PIKFYVEQ9Y2I7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PIKFYVEQ9Y2I7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PIKFYVEQ9Y2I7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PIKFYVEQ9Y2I7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PIKFYVEQ9Y2I7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PIKFYVEQ9Y2I7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PIKFYVEQ9Y2I7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PIKFYVEQ9Y2I7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PIKFYVEQ9Y2I7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
PIKFYVEQ9Y2I7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PIKFYVEQ9Y2I7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PIKFYVEQ9Y2I7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PIKFYVEQ9Y2I7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PIKFYVEQ9Y2I7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PIKFYVEQ9Y2I7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PIKFYVEQ9Y2I7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PIKFYVEQ9Y2I7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PIKFYVEQ9Y2I7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PIKFYVEQ9Y2I7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PIKFYVEQ9Y2I7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PIKFYVEQ9Y2I7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PIKFYVEQ9Y2I7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PIKFYVEQ9Y2I7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PIKFYVEQ9Y2I7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PIKFYVEQ9Y2I7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PIKFYVEQ9Y2I7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PIKFYVEQ9Y2I7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PIKFYVEQ9Y2I7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PIKFYVEQ9Y2I7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PIKFYVEQ9Y2I7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PIKFYVEQ9Y2I7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PIKFYVEQ9Y2I7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PIKFYVEQ9Y2I7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PIKFYVEQ9Y2I7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PIKFYVEQ9Y2I7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PIKFYVEQ9Y2I7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PIKFYVEQ9Y2I7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PIKFYVEQ9Y2I7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
PIKFYVEQ9Y2I7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PIKFYVEQ9Y2I7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PIKFYVEQ9Y2I7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PIKFYVEQ9Y2I7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PIKFYVEQ9Y2I7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PIKFYVEQ9Y2I7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PIKFYVEQ9Y2I7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms