Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKZ1

CNOT11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT11Q9UKZ1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNOT11Q9UKZ1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNOT11Q9UKZ1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNOT11Q9UKZ1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNOT11Q9UKZ1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNOT11Q9UKZ1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNOT11Q9UKZ1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNOT11Q9UKZ1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNOT11Q9UKZ1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNOT11Q9UKZ1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNOT11Q9UKZ1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNOT11Q9UKZ1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNOT11Q9UKZ1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNOT11Q9UKZ1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNOT11Q9UKZ1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNOT11Q9UKZ1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNOT11Q9UKZ1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNOT11Q9UKZ1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNOT11Q9UKZ1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNOT11Q9UKZ1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNOT11Q9UKZ1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNOT11Q9UKZ1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNOT11Q9UKZ1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNOT11Q9UKZ1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNOT11Q9UKZ1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNOT11Q9UKZ1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNOT11Q9UKZ1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CNOT11Q9UKZ1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNOT11Q9UKZ1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNOT11Q9UKZ1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CNOT11Q9UKZ1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNOT11Q9UKZ1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNOT11Q9UKZ1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNOT11Q9UKZ1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNOT11Q9UKZ1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNOT11Q9UKZ1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNOT11Q9UKZ1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNOT11Q9UKZ1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNOT11Q9UKZ1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNOT11Q9UKZ1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNOT11Q9UKZ1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNOT11Q9UKZ1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNOT11Q9UKZ1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNOT11Q9UKZ1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNOT11Q9UKZ1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNOT11Q9UKZ1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNOT11Q9UKZ1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNOT11Q9UKZ1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNOT11Q9UKZ1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNOT11Q9UKZ1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNOT11Q9UKZ1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNOT11Q9UKZ1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNOT11Q9UKZ1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNOT11Q9UKZ1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNOT11Q9UKZ1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CNOT11Q9UKZ1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CNOT11Q9UKZ1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CNOT11Q9UKZ1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CNOT11Q9UKZ1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CNOT11Q9UKZ1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNOT11Q9UKZ1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNOT11Q9UKZ1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNOT11Q9UKZ1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNOT11Q9UKZ1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNOT11Q9UKZ1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNOT11Q9UKZ1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNOT11Q9UKZ1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNOT11Q9UKZ1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNOT11Q9UKZ1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNOT11Q9UKZ1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNOT11Q9UKZ1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNOT11Q9UKZ1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNOT11Q9UKZ1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNOT11Q9UKZ1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CNOT11Q9UKZ1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNOT11Q9UKZ1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNOT11Q9UKZ1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNOT11Q9UKZ1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNOT11Q9UKZ1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNOT11Q9UKZ1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNOT11Q9UKZ1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNOT11Q9UKZ1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNOT11Q9UKZ1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNOT11Q9UKZ1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNOT11Q9UKZ1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNOT11Q9UKZ1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNOT11Q9UKZ1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNOT11Q9UKZ1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CNOT11Q9UKZ1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNOT11Q9UKZ1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNOT11Q9UKZ1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNOT11Q9UKZ1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CNOT11Q9UKZ1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CNOT11Q9UKZ1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNOT11Q9UKZ1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNOT11Q9UKZ1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNOT11Q9UKZ1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNOT11Q9UKZ1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNOT11Q9UKZ1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNOT11Q9UKZ1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms