Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG4

SLC13A4, Solute carrier family 13 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A4Q9UKG4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC13A4Q9UKG4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC13A4Q9UKG4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC13A4Q9UKG4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC13A4Q9UKG4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC13A4Q9UKG4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC13A4Q9UKG4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC13A4Q9UKG4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC13A4Q9UKG4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC13A4Q9UKG4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC13A4Q9UKG4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC13A4Q9UKG4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC13A4Q9UKG4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC13A4Q9UKG4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC13A4Q9UKG4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC13A4Q9UKG4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC13A4Q9UKG4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC13A4Q9UKG4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC13A4Q9UKG4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC13A4Q9UKG4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC13A4Q9UKG4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC13A4Q9UKG4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC13A4Q9UKG4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC13A4Q9UKG4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC13A4Q9UKG4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC13A4Q9UKG4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC13A4Q9UKG4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC13A4Q9UKG4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC13A4Q9UKG4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC13A4Q9UKG4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC13A4Q9UKG4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC13A4Q9UKG4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC13A4Q9UKG4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC13A4Q9UKG4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC13A4Q9UKG4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC13A4Q9UKG4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC13A4Q9UKG4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC13A4Q9UKG4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC13A4Q9UKG4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC13A4Q9UKG4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC13A4Q9UKG4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC13A4Q9UKG4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC13A4Q9UKG4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC13A4Q9UKG4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC13A4Q9UKG4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC13A4Q9UKG4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC13A4Q9UKG4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC13A4Q9UKG4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC13A4Q9UKG4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC13A4Q9UKG4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC13A4Q9UKG4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC13A4Q9UKG4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC13A4Q9UKG4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC13A4Q9UKG4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC13A4Q9UKG4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC13A4Q9UKG4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC13A4Q9UKG4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC13A4Q9UKG4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC13A4Q9UKG4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC13A4Q9UKG4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC13A4Q9UKG4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC13A4Q9UKG4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC13A4Q9UKG4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC13A4Q9UKG4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC13A4Q9UKG4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC13A4Q9UKG4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC13A4Q9UKG4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC13A4Q9UKG4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC13A4Q9UKG4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC13A4Q9UKG4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC13A4Q9UKG4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC13A4Q9UKG4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC13A4Q9UKG4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC13A4Q9UKG4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC13A4Q9UKG4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC13A4Q9UKG4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC13A4Q9UKG4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC13A4Q9UKG4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC13A4Q9UKG4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC13A4Q9UKG4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC13A4Q9UKG4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC13A4Q9UKG4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC13A4Q9UKG4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC13A4Q9UKG4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC13A4Q9UKG4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC13A4Q9UKG4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC13A4Q9UKG4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC13A4Q9UKG4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC13A4Q9UKG4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC13A4Q9UKG4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC13A4Q9UKG4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC13A4Q9UKG4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC13A4Q9UKG4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC13A4Q9UKG4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC13A4Q9UKG4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC13A4Q9UKG4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC13A4Q9UKG4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC13A4Q9UKG4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC13A4Q9UKG4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC13A4Q9UKG4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms