Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY4

GGA2, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA2, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA2Q9UJY4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
GGA2Q9UJY4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
GGA2Q9UJY4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
GGA2Q9UJY4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GGA2Q9UJY4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GGA2Q9UJY4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GGA2Q9UJY4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GGA2Q9UJY4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GGA2Q9UJY4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GGA2Q9UJY4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GGA2Q9UJY4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GGA2Q9UJY4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GGA2Q9UJY4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GGA2Q9UJY4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GGA2Q9UJY4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
GGA2Q9UJY4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GGA2Q9UJY4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GGA2Q9UJY4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GGA2Q9UJY4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GGA2Q9UJY4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GGA2Q9UJY4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GGA2Q9UJY4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GGA2Q9UJY4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GGA2Q9UJY4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
GGA2Q9UJY4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
GGA2Q9UJY4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
GGA2Q9UJY4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
GGA2Q9UJY4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
GGA2Q9UJY4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
GGA2Q9UJY4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
GGA2Q9UJY4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
GGA2Q9UJY4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
GGA2Q9UJY4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
GGA2Q9UJY4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GGA2Q9UJY4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GGA2Q9UJY4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GGA2Q9UJY4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GGA2Q9UJY4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GGA2Q9UJY4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GGA2Q9UJY4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GGA2Q9UJY4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GGA2Q9UJY4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GGA2Q9UJY4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GGA2Q9UJY4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GGA2Q9UJY4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GGA2Q9UJY4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GGA2Q9UJY4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GGA2Q9UJY4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GGA2Q9UJY4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GGA2Q9UJY4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GGA2Q9UJY4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GGA2Q9UJY4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GGA2Q9UJY4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GGA2Q9UJY4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GGA2Q9UJY4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GGA2Q9UJY4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GGA2Q9UJY4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GGA2Q9UJY4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
GGA2Q9UJY4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GGA2Q9UJY4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GGA2Q9UJY4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GGA2Q9UJY4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GGA2Q9UJY4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GGA2Q9UJY4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GGA2Q9UJY4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GGA2Q9UJY4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GGA2Q9UJY4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GGA2Q9UJY4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GGA2Q9UJY4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GGA2Q9UJY4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GGA2Q9UJY4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GGA2Q9UJY4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GGA2Q9UJY4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GGA2Q9UJY4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GGA2Q9UJY4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GGA2Q9UJY4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GGA2Q9UJY4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GGA2Q9UJY4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GGA2Q9UJY4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GGA2Q9UJY4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GGA2Q9UJY4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GGA2Q9UJY4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GGA2Q9UJY4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GGA2Q9UJY4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GGA2Q9UJY4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GGA2Q9UJY4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
GGA2Q9UJY4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GGA2Q9UJY4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GGA2Q9UJY4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GGA2Q9UJY4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
GGA2Q9UJY4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GGA2Q9UJY4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GGA2Q9UJY4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GGA2Q9UJY4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GGA2Q9UJY4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GGA2Q9UJY4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GGA2Q9UJY4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GGA2Q9UJY4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GGA2Q9UJY4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GGA2Q9UJY4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms