Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY4

GGA2, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA2, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA2Q9UJY4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
GGA2Q9UJY4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
GGA2Q9UJY4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
GGA2Q9UJY4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GGA2Q9UJY4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GGA2Q9UJY4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GGA2Q9UJY4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GGA2Q9UJY4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GGA2Q9UJY4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GGA2Q9UJY4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GGA2Q9UJY4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GGA2Q9UJY4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GGA2Q9UJY4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GGA2Q9UJY4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GGA2Q9UJY4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
GGA2Q9UJY4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GGA2Q9UJY4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GGA2Q9UJY4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GGA2Q9UJY4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GGA2Q9UJY4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GGA2Q9UJY4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GGA2Q9UJY4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GGA2Q9UJY4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GGA2Q9UJY4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
GGA2Q9UJY4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
GGA2Q9UJY4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
GGA2Q9UJY4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
GGA2Q9UJY4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
GGA2Q9UJY4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
GGA2Q9UJY4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
GGA2Q9UJY4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
GGA2Q9UJY4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
GGA2Q9UJY4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
GGA2Q9UJY4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GGA2Q9UJY4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GGA2Q9UJY4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GGA2Q9UJY4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GGA2Q9UJY4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GGA2Q9UJY4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GGA2Q9UJY4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GGA2Q9UJY4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GGA2Q9UJY4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GGA2Q9UJY4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GGA2Q9UJY4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GGA2Q9UJY4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GGA2Q9UJY4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GGA2Q9UJY4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GGA2Q9UJY4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GGA2Q9UJY4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GGA2Q9UJY4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GGA2Q9UJY4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GGA2Q9UJY4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GGA2Q9UJY4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GGA2Q9UJY4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GGA2Q9UJY4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GGA2Q9UJY4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GGA2Q9UJY4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GGA2Q9UJY4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
GGA2Q9UJY4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GGA2Q9UJY4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GGA2Q9UJY4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GGA2Q9UJY4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GGA2Q9UJY4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GGA2Q9UJY4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GGA2Q9UJY4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GGA2Q9UJY4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GGA2Q9UJY4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GGA2Q9UJY4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GGA2Q9UJY4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GGA2Q9UJY4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GGA2Q9UJY4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GGA2Q9UJY4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GGA2Q9UJY4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GGA2Q9UJY4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GGA2Q9UJY4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GGA2Q9UJY4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GGA2Q9UJY4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GGA2Q9UJY4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GGA2Q9UJY4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GGA2Q9UJY4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GGA2Q9UJY4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GGA2Q9UJY4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GGA2Q9UJY4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GGA2Q9UJY4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GGA2Q9UJY4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GGA2Q9UJY4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
GGA2Q9UJY4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GGA2Q9UJY4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GGA2Q9UJY4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GGA2Q9UJY4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
GGA2Q9UJY4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GGA2Q9UJY4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GGA2Q9UJY4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GGA2Q9UJY4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GGA2Q9UJY4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GGA2Q9UJY4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GGA2Q9UJY4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GGA2Q9UJY4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GGA2Q9UJY4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GGA2Q9UJY4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms