Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIL8

PHF11, PHD finger protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF11Q9UIL8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PHF11Q9UIL8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHF11Q9UIL8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHF11Q9UIL8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHF11Q9UIL8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHF11Q9UIL8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHF11Q9UIL8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHF11Q9UIL8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PHF11Q9UIL8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHF11Q9UIL8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHF11Q9UIL8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PHF11Q9UIL8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHF11Q9UIL8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHF11Q9UIL8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHF11Q9UIL8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHF11Q9UIL8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHF11Q9UIL8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHF11Q9UIL8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHF11Q9UIL8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHF11Q9UIL8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHF11Q9UIL8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHF11Q9UIL8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHF11Q9UIL8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHF11Q9UIL8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHF11Q9UIL8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHF11Q9UIL8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHF11Q9UIL8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHF11Q9UIL8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHF11Q9UIL8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHF11Q9UIL8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHF11Q9UIL8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHF11Q9UIL8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PHF11Q9UIL8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PHF11Q9UIL8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PHF11Q9UIL8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHF11Q9UIL8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHF11Q9UIL8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHF11Q9UIL8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PHF11Q9UIL8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PHF11Q9UIL8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PHF11Q9UIL8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PHF11Q9UIL8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PHF11Q9UIL8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHF11Q9UIL8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHF11Q9UIL8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHF11Q9UIL8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PHF11Q9UIL8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PHF11Q9UIL8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PHF11Q9UIL8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PHF11Q9UIL8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PHF11Q9UIL8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PHF11Q9UIL8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PHF11Q9UIL8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PHF11Q9UIL8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PHF11Q9UIL8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHF11Q9UIL8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHF11Q9UIL8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PHF11Q9UIL8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PHF11Q9UIL8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHF11Q9UIL8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHF11Q9UIL8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHF11Q9UIL8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PHF11Q9UIL8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PHF11Q9UIL8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHF11Q9UIL8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHF11Q9UIL8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHF11Q9UIL8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHF11Q9UIL8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHF11Q9UIL8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHF11Q9UIL8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHF11Q9UIL8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHF11Q9UIL8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHF11Q9UIL8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHF11Q9UIL8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHF11Q9UIL8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHF11Q9UIL8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHF11Q9UIL8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHF11Q9UIL8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHF11Q9UIL8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHF11Q9UIL8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHF11Q9UIL8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHF11Q9UIL8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHF11Q9UIL8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHF11Q9UIL8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHF11Q9UIL8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHF11Q9UIL8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PHF11Q9UIL8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PHF11Q9UIL8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PHF11Q9UIL8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PHF11Q9UIL8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PHF11Q9UIL8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PHF11Q9UIL8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PHF11Q9UIL8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PHF11Q9UIL8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PHF11Q9UIL8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PHF11Q9UIL8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PHF11Q9UIL8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PHF11Q9UIL8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PHF11Q9UIL8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PHF11Q9UIL8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms