Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI43

MRM2, rRNA methyltransferase 2, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRM2Q9UI43 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRM2Q9UI43 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRM2Q9UI43 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRM2Q9UI43 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRM2Q9UI43 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRM2Q9UI43 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRM2Q9UI43 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRM2Q9UI43 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRM2Q9UI43 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRM2Q9UI43 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRM2Q9UI43 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRM2Q9UI43 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRM2Q9UI43 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRM2Q9UI43 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRM2Q9UI43 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRM2Q9UI43 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRM2Q9UI43 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRM2Q9UI43 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MRM2Q9UI43 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRM2Q9UI43 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MRM2Q9UI43 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRM2Q9UI43 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRM2Q9UI43 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRM2Q9UI43 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRM2Q9UI43 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRM2Q9UI43 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRM2Q9UI43 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRM2Q9UI43 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRM2Q9UI43 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MRM2Q9UI43 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRM2Q9UI43 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRM2Q9UI43 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRM2Q9UI43 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MRM2Q9UI43 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRM2Q9UI43 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRM2Q9UI43 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRM2Q9UI43 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRM2Q9UI43 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRM2Q9UI43 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRM2Q9UI43 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRM2Q9UI43 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRM2Q9UI43 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MRM2Q9UI43 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRM2Q9UI43 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRM2Q9UI43 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRM2Q9UI43 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
MRM2Q9UI43 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MRM2Q9UI43 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MRM2Q9UI43 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRM2Q9UI43 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRM2Q9UI43 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRM2Q9UI43 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRM2Q9UI43 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRM2Q9UI43 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRM2Q9UI43 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRM2Q9UI43 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRM2Q9UI43 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRM2Q9UI43 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRM2Q9UI43 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRM2Q9UI43 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRM2Q9UI43 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MRM2Q9UI43 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRM2Q9UI43 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRM2Q9UI43 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRM2Q9UI43 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRM2Q9UI43 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRM2Q9UI43 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRM2Q9UI43 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRM2Q9UI43 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MRM2Q9UI43 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRM2Q9UI43 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRM2Q9UI43 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRM2Q9UI43 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRM2Q9UI43 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRM2Q9UI43 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRM2Q9UI43 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MRM2Q9UI43 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRM2Q9UI43 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRM2Q9UI43 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRM2Q9UI43 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRM2Q9UI43 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRM2Q9UI43 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRM2Q9UI43 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRM2Q9UI43 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MRM2Q9UI43 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRM2Q9UI43 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRM2Q9UI43 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRM2Q9UI43 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRM2Q9UI43 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRM2Q9UI43 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRM2Q9UI43 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRM2Q9UI43 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRM2Q9UI43 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRM2Q9UI43 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRM2Q9UI43 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRM2Q9UI43 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRM2Q9UI43 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRM2Q9UI43 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRM2Q9UI43 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRM2Q9UI43 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms