Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHM6

OPN4, Melanopsin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN4Q9UHM6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
OPN4Q9UHM6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
OPN4Q9UHM6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
OPN4Q9UHM6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
OPN4Q9UHM6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
OPN4Q9UHM6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
OPN4Q9UHM6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
OPN4Q9UHM6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
OPN4Q9UHM6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
OPN4Q9UHM6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
OPN4Q9UHM6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
OPN4Q9UHM6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
OPN4Q9UHM6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
OPN4Q9UHM6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
OPN4Q9UHM6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
OPN4Q9UHM6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
OPN4Q9UHM6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
OPN4Q9UHM6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
OPN4Q9UHM6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
OPN4Q9UHM6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
OPN4Q9UHM6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
OPN4Q9UHM6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
OPN4Q9UHM6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
OPN4Q9UHM6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
OPN4Q9UHM6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
OPN4Q9UHM6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
OPN4Q9UHM6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
OPN4Q9UHM6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
OPN4Q9UHM6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
OPN4Q9UHM6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
OPN4Q9UHM6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
OPN4Q9UHM6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
OPN4Q9UHM6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
OPN4Q9UHM6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
OPN4Q9UHM6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
OPN4Q9UHM6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
OPN4Q9UHM6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
OPN4Q9UHM6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
OPN4Q9UHM6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
OPN4Q9UHM6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
OPN4Q9UHM6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
OPN4Q9UHM6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
OPN4Q9UHM6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
OPN4Q9UHM6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
OPN4Q9UHM6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
OPN4Q9UHM6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
OPN4Q9UHM6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
OPN4Q9UHM6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
OPN4Q9UHM6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
OPN4Q9UHM6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
OPN4Q9UHM6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
OPN4Q9UHM6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
OPN4Q9UHM6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
OPN4Q9UHM6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
OPN4Q9UHM6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
OPN4Q9UHM6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
OPN4Q9UHM6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
OPN4Q9UHM6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
OPN4Q9UHM6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
OPN4Q9UHM6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
OPN4Q9UHM6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
OPN4Q9UHM6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
OPN4Q9UHM6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
OPN4Q9UHM6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
OPN4Q9UHM6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
OPN4Q9UHM6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
OPN4Q9UHM6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
OPN4Q9UHM6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
OPN4Q9UHM6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
OPN4Q9UHM6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
OPN4Q9UHM6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
OPN4Q9UHM6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
OPN4Q9UHM6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
OPN4Q9UHM6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
OPN4Q9UHM6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
OPN4Q9UHM6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
OPN4Q9UHM6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
OPN4Q9UHM6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
OPN4Q9UHM6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
OPN4Q9UHM6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
OPN4Q9UHM6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
OPN4Q9UHM6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
OPN4Q9UHM6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
OPN4Q9UHM6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
OPN4Q9UHM6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
OPN4Q9UHM6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
OPN4Q9UHM6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
OPN4Q9UHM6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
OPN4Q9UHM6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
OPN4Q9UHM6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
OPN4Q9UHM6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
OPN4Q9UHM6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
OPN4Q9UHM6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
OPN4Q9UHM6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
OPN4Q9UHM6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
OPN4Q9UHM6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
OPN4Q9UHM6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
OPN4Q9UHM6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
OPN4Q9UHM6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
OPN4Q9UHM6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.8 ms