Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFF9

CNOT8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT8Q9UFF9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CNOT8Q9UFF9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CNOT8Q9UFF9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CNOT8Q9UFF9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CNOT8Q9UFF9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CNOT8Q9UFF9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CNOT8Q9UFF9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CNOT8Q9UFF9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CNOT8Q9UFF9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CNOT8Q9UFF9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CNOT8Q9UFF9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CNOT8Q9UFF9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CNOT8Q9UFF9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CNOT8Q9UFF9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CNOT8Q9UFF9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CNOT8Q9UFF9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CNOT8Q9UFF9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CNOT8Q9UFF9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CNOT8Q9UFF9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CNOT8Q9UFF9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CNOT8Q9UFF9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CNOT8Q9UFF9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CNOT8Q9UFF9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CNOT8Q9UFF9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CNOT8Q9UFF9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CNOT8Q9UFF9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CNOT8Q9UFF9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CNOT8Q9UFF9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CNOT8Q9UFF9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CNOT8Q9UFF9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CNOT8Q9UFF9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CNOT8Q9UFF9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CNOT8Q9UFF9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CNOT8Q9UFF9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CNOT8Q9UFF9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CNOT8Q9UFF9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CNOT8Q9UFF9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CNOT8Q9UFF9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CNOT8Q9UFF9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CNOT8Q9UFF9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CNOT8Q9UFF9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CNOT8Q9UFF9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CNOT8Q9UFF9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CNOT8Q9UFF9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CNOT8Q9UFF9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CNOT8Q9UFF9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CNOT8Q9UFF9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CNOT8Q9UFF9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CNOT8Q9UFF9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CNOT8Q9UFF9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CNOT8Q9UFF9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CNOT8Q9UFF9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CNOT8Q9UFF9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CNOT8Q9UFF9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CNOT8Q9UFF9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNOT8Q9UFF9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNOT8Q9UFF9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNOT8Q9UFF9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNOT8Q9UFF9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNOT8Q9UFF9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CNOT8Q9UFF9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CNOT8Q9UFF9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CNOT8Q9UFF9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CNOT8Q9UFF9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CNOT8Q9UFF9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CNOT8Q9UFF9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CNOT8Q9UFF9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CNOT8Q9UFF9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CNOT8Q9UFF9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CNOT8Q9UFF9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CNOT8Q9UFF9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CNOT8Q9UFF9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CNOT8Q9UFF9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CNOT8Q9UFF9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CNOT8Q9UFF9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNOT8Q9UFF9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNOT8Q9UFF9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNOT8Q9UFF9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNOT8Q9UFF9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNOT8Q9UFF9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CNOT8Q9UFF9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CNOT8Q9UFF9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CNOT8Q9UFF9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CNOT8Q9UFF9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CNOT8Q9UFF9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CNOT8Q9UFF9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CNOT8Q9UFF9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNOT8Q9UFF9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNOT8Q9UFF9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNOT8Q9UFF9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNOT8Q9UFF9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNOT8Q9UFF9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNOT8Q9UFF9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNOT8Q9UFF9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNOT8Q9UFF9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CNOT8Q9UFF9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNOT8Q9UFF9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CNOT8Q9UFF9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CNOT8Q9UFF9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CNOT8Q9UFF9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms