Protein–RNA interactions for Protein: Q9P086

MED11, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED11Q9P086 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MED11Q9P086 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MED11Q9P086 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MED11Q9P086 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MED11Q9P086 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MED11Q9P086 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MED11Q9P086 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MED11Q9P086 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MED11Q9P086 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MED11Q9P086 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MED11Q9P086 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MED11Q9P086 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MED11Q9P086 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MED11Q9P086 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MED11Q9P086 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MED11Q9P086 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MED11Q9P086 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MED11Q9P086 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MED11Q9P086 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MED11Q9P086 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MED11Q9P086 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MED11Q9P086 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MED11Q9P086 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MED11Q9P086 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MED11Q9P086 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MED11Q9P086 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MED11Q9P086 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MED11Q9P086 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MED11Q9P086 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MED11Q9P086 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MED11Q9P086 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MED11Q9P086 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MED11Q9P086 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MED11Q9P086 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MED11Q9P086 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MED11Q9P086 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MED11Q9P086 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MED11Q9P086 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MED11Q9P086 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MED11Q9P086 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MED11Q9P086 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MED11Q9P086 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MED11Q9P086 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MED11Q9P086 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MED11Q9P086 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MED11Q9P086 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MED11Q9P086 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MED11Q9P086 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MED11Q9P086 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MED11Q9P086 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MED11Q9P086 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MED11Q9P086 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MED11Q9P086 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MED11Q9P086 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MED11Q9P086 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MED11Q9P086 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MED11Q9P086 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MED11Q9P086 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MED11Q9P086 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MED11Q9P086 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MED11Q9P086 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MED11Q9P086 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MED11Q9P086 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MED11Q9P086 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MED11Q9P086 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MED11Q9P086 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MED11Q9P086 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MED11Q9P086 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MED11Q9P086 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MED11Q9P086 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MED11Q9P086 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MED11Q9P086 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MED11Q9P086 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MED11Q9P086 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MED11Q9P086 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MED11Q9P086 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MED11Q9P086 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MED11Q9P086 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MED11Q9P086 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MED11Q9P086 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MED11Q9P086 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MED11Q9P086 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MED11Q9P086 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MED11Q9P086 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MED11Q9P086 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MED11Q9P086 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MED11Q9P086 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MED11Q9P086 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MED11Q9P086 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MED11Q9P086 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MED11Q9P086 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MED11Q9P086 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MED11Q9P086 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MED11Q9P086 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MED11Q9P086 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MED11Q9P086 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MED11Q9P086 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MED11Q9P086 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MED11Q9P086 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MED11Q9P086 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms