Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ71

RTEL1, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1Q9NZ71 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RTEL1Q9NZ71 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RTEL1Q9NZ71 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RTEL1Q9NZ71 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RTEL1Q9NZ71 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RTEL1Q9NZ71 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
RTEL1Q9NZ71 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RTEL1Q9NZ71 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
RTEL1Q9NZ71 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RTEL1Q9NZ71 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
RTEL1Q9NZ71 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RTEL1Q9NZ71 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RTEL1Q9NZ71 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RTEL1Q9NZ71 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RTEL1Q9NZ71 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RTEL1Q9NZ71 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RTEL1Q9NZ71 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RTEL1Q9NZ71 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RTEL1Q9NZ71 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RTEL1Q9NZ71 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RTEL1Q9NZ71 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RTEL1Q9NZ71 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RTEL1Q9NZ71 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
RTEL1Q9NZ71 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
RTEL1Q9NZ71 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RTEL1Q9NZ71 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
RTEL1Q9NZ71 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.47■■■□□ 2.31
RTEL1Q9NZ71 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
RTEL1Q9NZ71 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RTEL1Q9NZ71 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
RTEL1Q9NZ71 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
RTEL1Q9NZ71 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
RTEL1Q9NZ71 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
RTEL1Q9NZ71 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
RTEL1Q9NZ71 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
RTEL1Q9NZ71 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
RTEL1Q9NZ71 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
RTEL1Q9NZ71 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
RTEL1Q9NZ71 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
RTEL1Q9NZ71 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RTEL1Q9NZ71 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
RTEL1Q9NZ71 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RTEL1Q9NZ71 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RTEL1Q9NZ71 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RTEL1Q9NZ71 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RTEL1Q9NZ71 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RTEL1Q9NZ71 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
RTEL1Q9NZ71 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RTEL1Q9NZ71 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RTEL1Q9NZ71 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RTEL1Q9NZ71 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RTEL1Q9NZ71 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RTEL1Q9NZ71 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RTEL1Q9NZ71 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RTEL1Q9NZ71 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RTEL1Q9NZ71 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RTEL1Q9NZ71 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RTEL1Q9NZ71 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RTEL1Q9NZ71 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RTEL1Q9NZ71 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RTEL1Q9NZ71 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RTEL1Q9NZ71 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RTEL1Q9NZ71 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RTEL1Q9NZ71 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RTEL1Q9NZ71 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RTEL1Q9NZ71 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RTEL1Q9NZ71 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RTEL1Q9NZ71 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RTEL1Q9NZ71 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RTEL1Q9NZ71 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RTEL1Q9NZ71 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
RTEL1Q9NZ71 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RTEL1Q9NZ71 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RTEL1Q9NZ71 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RTEL1Q9NZ71 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RTEL1Q9NZ71 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RTEL1Q9NZ71 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RTEL1Q9NZ71 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RTEL1Q9NZ71 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
RTEL1Q9NZ71 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RTEL1Q9NZ71 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RTEL1Q9NZ71 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RTEL1Q9NZ71 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
RTEL1Q9NZ71 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RTEL1Q9NZ71 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RTEL1Q9NZ71 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
RTEL1Q9NZ71 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RTEL1Q9NZ71 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RTEL1Q9NZ71 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
RTEL1Q9NZ71 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RTEL1Q9NZ71 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
RTEL1Q9NZ71 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RTEL1Q9NZ71 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RTEL1Q9NZ71 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RTEL1Q9NZ71 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RTEL1Q9NZ71 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RTEL1Q9NZ71 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RTEL1Q9NZ71 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RTEL1Q9NZ71 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RTEL1Q9NZ71 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms