Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY35

CLDND1, Claudin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDND1Q9NY35 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLDND1Q9NY35 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLDND1Q9NY35 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLDND1Q9NY35 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLDND1Q9NY35 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLDND1Q9NY35 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLDND1Q9NY35 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLDND1Q9NY35 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLDND1Q9NY35 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLDND1Q9NY35 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLDND1Q9NY35 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLDND1Q9NY35 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLDND1Q9NY35 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLDND1Q9NY35 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLDND1Q9NY35 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLDND1Q9NY35 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CLDND1Q9NY35 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLDND1Q9NY35 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLDND1Q9NY35 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLDND1Q9NY35 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLDND1Q9NY35 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CLDND1Q9NY35 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CLDND1Q9NY35 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CLDND1Q9NY35 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CLDND1Q9NY35 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CLDND1Q9NY35 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLDND1Q9NY35 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLDND1Q9NY35 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CLDND1Q9NY35 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CLDND1Q9NY35 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLDND1Q9NY35 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLDND1Q9NY35 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLDND1Q9NY35 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLDND1Q9NY35 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLDND1Q9NY35 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CLDND1Q9NY35 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CLDND1Q9NY35 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CLDND1Q9NY35 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CLDND1Q9NY35 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CLDND1Q9NY35 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CLDND1Q9NY35 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CLDND1Q9NY35 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CLDND1Q9NY35 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLDND1Q9NY35 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CLDND1Q9NY35 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLDND1Q9NY35 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLDND1Q9NY35 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CLDND1Q9NY35 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CLDND1Q9NY35 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CLDND1Q9NY35 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CLDND1Q9NY35 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CLDND1Q9NY35 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CLDND1Q9NY35 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CLDND1Q9NY35 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CLDND1Q9NY35 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CLDND1Q9NY35 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CLDND1Q9NY35 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLDND1Q9NY35 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLDND1Q9NY35 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CLDND1Q9NY35 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLDND1Q9NY35 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CLDND1Q9NY35 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CLDND1Q9NY35 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CLDND1Q9NY35 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CLDND1Q9NY35 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CLDND1Q9NY35 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLDND1Q9NY35 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CLDND1Q9NY35 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CLDND1Q9NY35 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLDND1Q9NY35 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLDND1Q9NY35 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CLDND1Q9NY35 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CLDND1Q9NY35 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLDND1Q9NY35 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLDND1Q9NY35 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLDND1Q9NY35 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLDND1Q9NY35 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLDND1Q9NY35 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLDND1Q9NY35 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLDND1Q9NY35 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLDND1Q9NY35 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CLDND1Q9NY35 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLDND1Q9NY35 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLDND1Q9NY35 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLDND1Q9NY35 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLDND1Q9NY35 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLDND1Q9NY35 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLDND1Q9NY35 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLDND1Q9NY35 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLDND1Q9NY35 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLDND1Q9NY35 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLDND1Q9NY35 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLDND1Q9NY35 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLDND1Q9NY35 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLDND1Q9NY35 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CLDND1Q9NY35 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLDND1Q9NY35 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLDND1Q9NY35 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLDND1Q9NY35 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLDND1Q9NY35 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms