Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW38

FANCL, E3 ubiquitin-protein ligase FANCL, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCLQ9NW38 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FANCLQ9NW38 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FANCLQ9NW38 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FANCLQ9NW38 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FANCLQ9NW38 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FANCLQ9NW38 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FANCLQ9NW38 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FANCLQ9NW38 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FANCLQ9NW38 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FANCLQ9NW38 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FANCLQ9NW38 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FANCLQ9NW38 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FANCLQ9NW38 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FANCLQ9NW38 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FANCLQ9NW38 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FANCLQ9NW38 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FANCLQ9NW38 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FANCLQ9NW38 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FANCLQ9NW38 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FANCLQ9NW38 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FANCLQ9NW38 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FANCLQ9NW38 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FANCLQ9NW38 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FANCLQ9NW38 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FANCLQ9NW38 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FANCLQ9NW38 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FANCLQ9NW38 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FANCLQ9NW38 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FANCLQ9NW38 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FANCLQ9NW38 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FANCLQ9NW38 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FANCLQ9NW38 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FANCLQ9NW38 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FANCLQ9NW38 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FANCLQ9NW38 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
FANCLQ9NW38 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FANCLQ9NW38 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
FANCLQ9NW38 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
FANCLQ9NW38 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FANCLQ9NW38 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FANCLQ9NW38 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FANCLQ9NW38 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FANCLQ9NW38 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FANCLQ9NW38 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
FANCLQ9NW38 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
FANCLQ9NW38 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
FANCLQ9NW38 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FANCLQ9NW38 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FANCLQ9NW38 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
FANCLQ9NW38 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
FANCLQ9NW38 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FANCLQ9NW38 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FANCLQ9NW38 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FANCLQ9NW38 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
FANCLQ9NW38 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FANCLQ9NW38 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
FANCLQ9NW38 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
FANCLQ9NW38 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
FANCLQ9NW38 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
FANCLQ9NW38 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FANCLQ9NW38 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FANCLQ9NW38 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
FANCLQ9NW38 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
FANCLQ9NW38 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
FANCLQ9NW38 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FANCLQ9NW38 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FANCLQ9NW38 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FANCLQ9NW38 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FANCLQ9NW38 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FANCLQ9NW38 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FANCLQ9NW38 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
FANCLQ9NW38 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
FANCLQ9NW38 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FANCLQ9NW38 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FANCLQ9NW38 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FANCLQ9NW38 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FANCLQ9NW38 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
FANCLQ9NW38 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
FANCLQ9NW38 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
FANCLQ9NW38 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
FANCLQ9NW38 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
FANCLQ9NW38 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FANCLQ9NW38 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
FANCLQ9NW38 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FANCLQ9NW38 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
FANCLQ9NW38 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FANCLQ9NW38 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FANCLQ9NW38 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FANCLQ9NW38 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FANCLQ9NW38 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FANCLQ9NW38 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FANCLQ9NW38 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FANCLQ9NW38 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FANCLQ9NW38 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
FANCLQ9NW38 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FANCLQ9NW38 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FANCLQ9NW38 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
FANCLQ9NW38 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FANCLQ9NW38 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
FANCLQ9NW38 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms