Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV44

LINC00846, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00846, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00846Q9NV44 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00846Q9NV44 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00846Q9NV44 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00846Q9NV44 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00846Q9NV44 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00846Q9NV44 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00846Q9NV44 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00846Q9NV44 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00846Q9NV44 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00846Q9NV44 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00846Q9NV44 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00846Q9NV44 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00846Q9NV44 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00846Q9NV44 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00846Q9NV44 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00846Q9NV44 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00846Q9NV44 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00846Q9NV44 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00846Q9NV44 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00846Q9NV44 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00846Q9NV44 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00846Q9NV44 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00846Q9NV44 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00846Q9NV44 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00846Q9NV44 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00846Q9NV44 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00846Q9NV44 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00846Q9NV44 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00846Q9NV44 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00846Q9NV44 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00846Q9NV44 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00846Q9NV44 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00846Q9NV44 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00846Q9NV44 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00846Q9NV44 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00846Q9NV44 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00846Q9NV44 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00846Q9NV44 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00846Q9NV44 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00846Q9NV44 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00846Q9NV44 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00846Q9NV44 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00846Q9NV44 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00846Q9NV44 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00846Q9NV44 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00846Q9NV44 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00846Q9NV44 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00846Q9NV44 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00846Q9NV44 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00846Q9NV44 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00846Q9NV44 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00846Q9NV44 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00846Q9NV44 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00846Q9NV44 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00846Q9NV44 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00846Q9NV44 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00846Q9NV44 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00846Q9NV44 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00846Q9NV44 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00846Q9NV44 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00846Q9NV44 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00846Q9NV44 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00846Q9NV44 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00846Q9NV44 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00846Q9NV44 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00846Q9NV44 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00846Q9NV44 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00846Q9NV44 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00846Q9NV44 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00846Q9NV44 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00846Q9NV44 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00846Q9NV44 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00846Q9NV44 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LINC00846Q9NV44 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LINC00846Q9NV44 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00846Q9NV44 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00846Q9NV44 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00846Q9NV44 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00846Q9NV44 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00846Q9NV44 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00846Q9NV44 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00846Q9NV44 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00846Q9NV44 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00846Q9NV44 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00846Q9NV44 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00846Q9NV44 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00846Q9NV44 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00846Q9NV44 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00846Q9NV44 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00846Q9NV44 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00846Q9NV44 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00846Q9NV44 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00846Q9NV44 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00846Q9NV44 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00846Q9NV44 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00846Q9NV44 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00846Q9NV44 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00846Q9NV44 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00846Q9NV44 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00846Q9NV44 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms