Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPMQ9NSP4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPMQ9NSP4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPMQ9NSP4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPMQ9NSP4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPMQ9NSP4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPMQ9NSP4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPMQ9NSP4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPMQ9NSP4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPMQ9NSP4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPMQ9NSP4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPMQ9NSP4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPMQ9NSP4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPMQ9NSP4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPMQ9NSP4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPMQ9NSP4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPMQ9NSP4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPMQ9NSP4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPMQ9NSP4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPMQ9NSP4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPMQ9NSP4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CENPMQ9NSP4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CENPMQ9NSP4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CENPMQ9NSP4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CENPMQ9NSP4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
CENPMQ9NSP4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CENPMQ9NSP4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPMQ9NSP4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPMQ9NSP4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPMQ9NSP4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPMQ9NSP4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPMQ9NSP4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPMQ9NSP4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPMQ9NSP4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPMQ9NSP4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPMQ9NSP4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CENPMQ9NSP4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CENPMQ9NSP4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CENPMQ9NSP4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CENPMQ9NSP4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CENPMQ9NSP4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CENPMQ9NSP4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CENPMQ9NSP4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CENPMQ9NSP4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CENPMQ9NSP4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CENPMQ9NSP4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CENPMQ9NSP4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CENPMQ9NSP4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CENPMQ9NSP4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CENPMQ9NSP4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CENPMQ9NSP4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CENPMQ9NSP4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CENPMQ9NSP4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CENPMQ9NSP4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CENPMQ9NSP4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CENPMQ9NSP4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CENPMQ9NSP4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CENPMQ9NSP4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CENPMQ9NSP4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPMQ9NSP4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPMQ9NSP4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPMQ9NSP4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPMQ9NSP4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPMQ9NSP4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPMQ9NSP4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPMQ9NSP4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPMQ9NSP4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPMQ9NSP4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPMQ9NSP4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPMQ9NSP4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPMQ9NSP4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPMQ9NSP4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPMQ9NSP4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPMQ9NSP4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPMQ9NSP4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPMQ9NSP4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPMQ9NSP4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPMQ9NSP4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPMQ9NSP4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPMQ9NSP4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPMQ9NSP4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPMQ9NSP4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPMQ9NSP4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPMQ9NSP4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPMQ9NSP4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPMQ9NSP4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPMQ9NSP4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPMQ9NSP4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPMQ9NSP4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPMQ9NSP4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPMQ9NSP4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPMQ9NSP4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPMQ9NSP4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPMQ9NSP4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPMQ9NSP4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPMQ9NSP4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPMQ9NSP4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPMQ9NSP4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPMQ9NSP4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPMQ9NSP4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms