Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS23

RASSF1, Ras association domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF1Q9NS23 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RASSF1Q9NS23 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RASSF1Q9NS23 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RASSF1Q9NS23 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RASSF1Q9NS23 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RASSF1Q9NS23 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RASSF1Q9NS23 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RASSF1Q9NS23 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RASSF1Q9NS23 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RASSF1Q9NS23 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RASSF1Q9NS23 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RASSF1Q9NS23 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RASSF1Q9NS23 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RASSF1Q9NS23 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RASSF1Q9NS23 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RASSF1Q9NS23 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RASSF1Q9NS23 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RASSF1Q9NS23 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RASSF1Q9NS23 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RASSF1Q9NS23 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RASSF1Q9NS23 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RASSF1Q9NS23 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RASSF1Q9NS23 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RASSF1Q9NS23 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RASSF1Q9NS23 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RASSF1Q9NS23 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RASSF1Q9NS23 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RASSF1Q9NS23 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RASSF1Q9NS23 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RASSF1Q9NS23 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RASSF1Q9NS23 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RASSF1Q9NS23 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RASSF1Q9NS23 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RASSF1Q9NS23 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RASSF1Q9NS23 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RASSF1Q9NS23 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RASSF1Q9NS23 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RASSF1Q9NS23 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RASSF1Q9NS23 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RASSF1Q9NS23 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RASSF1Q9NS23 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RASSF1Q9NS23 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RASSF1Q9NS23 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RASSF1Q9NS23 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RASSF1Q9NS23 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RASSF1Q9NS23 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RASSF1Q9NS23 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RASSF1Q9NS23 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RASSF1Q9NS23 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RASSF1Q9NS23 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RASSF1Q9NS23 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RASSF1Q9NS23 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RASSF1Q9NS23 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RASSF1Q9NS23 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RASSF1Q9NS23 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RASSF1Q9NS23 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RASSF1Q9NS23 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RASSF1Q9NS23 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RASSF1Q9NS23 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RASSF1Q9NS23 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RASSF1Q9NS23 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RASSF1Q9NS23 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RASSF1Q9NS23 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RASSF1Q9NS23 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RASSF1Q9NS23 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RASSF1Q9NS23 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RASSF1Q9NS23 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RASSF1Q9NS23 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RASSF1Q9NS23 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RASSF1Q9NS23 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RASSF1Q9NS23 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RASSF1Q9NS23 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RASSF1Q9NS23 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RASSF1Q9NS23 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RASSF1Q9NS23 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RASSF1Q9NS23 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RASSF1Q9NS23 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RASSF1Q9NS23 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RASSF1Q9NS23 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RASSF1Q9NS23 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RASSF1Q9NS23 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RASSF1Q9NS23 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RASSF1Q9NS23 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RASSF1Q9NS23 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RASSF1Q9NS23 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RASSF1Q9NS23 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RASSF1Q9NS23 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RASSF1Q9NS23 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RASSF1Q9NS23 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RASSF1Q9NS23 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RASSF1Q9NS23 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RASSF1Q9NS23 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RASSF1Q9NS23 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RASSF1Q9NS23 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RASSF1Q9NS23 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RASSF1Q9NS23 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RASSF1Q9NS23 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RASSF1Q9NS23 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RASSF1Q9NS23 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RASSF1Q9NS23 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 155.2 ms