Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC3

CCNB1IP1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNB1IP1Q9NPC3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCNB1IP1Q9NPC3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCNB1IP1Q9NPC3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCNB1IP1Q9NPC3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCNB1IP1Q9NPC3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCNB1IP1Q9NPC3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCNB1IP1Q9NPC3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCNB1IP1Q9NPC3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCNB1IP1Q9NPC3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCNB1IP1Q9NPC3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCNB1IP1Q9NPC3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCNB1IP1Q9NPC3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCNB1IP1Q9NPC3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCNB1IP1Q9NPC3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCNB1IP1Q9NPC3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCNB1IP1Q9NPC3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNB1IP1Q9NPC3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNB1IP1Q9NPC3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNB1IP1Q9NPC3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNB1IP1Q9NPC3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNB1IP1Q9NPC3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNB1IP1Q9NPC3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNB1IP1Q9NPC3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCNB1IP1Q9NPC3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCNB1IP1Q9NPC3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCNB1IP1Q9NPC3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCNB1IP1Q9NPC3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCNB1IP1Q9NPC3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCNB1IP1Q9NPC3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCNB1IP1Q9NPC3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCNB1IP1Q9NPC3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCNB1IP1Q9NPC3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCNB1IP1Q9NPC3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCNB1IP1Q9NPC3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCNB1IP1Q9NPC3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCNB1IP1Q9NPC3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCNB1IP1Q9NPC3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCNB1IP1Q9NPC3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCNB1IP1Q9NPC3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCNB1IP1Q9NPC3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CCNB1IP1Q9NPC3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCNB1IP1Q9NPC3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCNB1IP1Q9NPC3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCNB1IP1Q9NPC3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCNB1IP1Q9NPC3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCNB1IP1Q9NPC3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCNB1IP1Q9NPC3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCNB1IP1Q9NPC3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCNB1IP1Q9NPC3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCNB1IP1Q9NPC3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCNB1IP1Q9NPC3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCNB1IP1Q9NPC3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CCNB1IP1Q9NPC3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CCNB1IP1Q9NPC3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCNB1IP1Q9NPC3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCNB1IP1Q9NPC3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCNB1IP1Q9NPC3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCNB1IP1Q9NPC3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNB1IP1Q9NPC3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNB1IP1Q9NPC3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNB1IP1Q9NPC3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNB1IP1Q9NPC3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNB1IP1Q9NPC3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNB1IP1Q9NPC3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCNB1IP1Q9NPC3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 371 ms