Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP78

ABCB9, ATP-binding cassette sub-family B member 9, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB9Q9NP78 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCB9Q9NP78 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCB9Q9NP78 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCB9Q9NP78 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCB9Q9NP78 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCB9Q9NP78 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCB9Q9NP78 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCB9Q9NP78 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ABCB9Q9NP78 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ABCB9Q9NP78 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ABCB9Q9NP78 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ABCB9Q9NP78 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ABCB9Q9NP78 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ABCB9Q9NP78 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ABCB9Q9NP78 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABCB9Q9NP78 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABCB9Q9NP78 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABCB9Q9NP78 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABCB9Q9NP78 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABCB9Q9NP78 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABCB9Q9NP78 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABCB9Q9NP78 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABCB9Q9NP78 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCB9Q9NP78 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCB9Q9NP78 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCB9Q9NP78 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCB9Q9NP78 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCB9Q9NP78 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCB9Q9NP78 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCB9Q9NP78 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCB9Q9NP78 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCB9Q9NP78 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCB9Q9NP78 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCB9Q9NP78 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCB9Q9NP78 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCB9Q9NP78 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCB9Q9NP78 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCB9Q9NP78 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCB9Q9NP78 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCB9Q9NP78 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCB9Q9NP78 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCB9Q9NP78 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCB9Q9NP78 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCB9Q9NP78 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCB9Q9NP78 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCB9Q9NP78 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCB9Q9NP78 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCB9Q9NP78 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCB9Q9NP78 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCB9Q9NP78 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCB9Q9NP78 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCB9Q9NP78 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCB9Q9NP78 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCB9Q9NP78 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCB9Q9NP78 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCB9Q9NP78 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCB9Q9NP78 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCB9Q9NP78 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCB9Q9NP78 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCB9Q9NP78 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCB9Q9NP78 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCB9Q9NP78 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCB9Q9NP78 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCB9Q9NP78 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCB9Q9NP78 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCB9Q9NP78 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCB9Q9NP78 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCB9Q9NP78 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCB9Q9NP78 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
ABCB9Q9NP78 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCB9Q9NP78 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCB9Q9NP78 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCB9Q9NP78 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCB9Q9NP78 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCB9Q9NP78 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCB9Q9NP78 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCB9Q9NP78 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCB9Q9NP78 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCB9Q9NP78 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCB9Q9NP78 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCB9Q9NP78 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCB9Q9NP78 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCB9Q9NP78 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCB9Q9NP78 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCB9Q9NP78 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCB9Q9NP78 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCB9Q9NP78 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCB9Q9NP78 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCB9Q9NP78 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCB9Q9NP78 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCB9Q9NP78 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCB9Q9NP78 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCB9Q9NP78 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCB9Q9NP78 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCB9Q9NP78 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCB9Q9NP78 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCB9Q9NP78 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCB9Q9NP78 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCB9Q9NP78 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCB9Q9NP78 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms