Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6K4

OPA3, Optic atrophy 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPA3Q9H6K4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
OPA3Q9H6K4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
OPA3Q9H6K4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
OPA3Q9H6K4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
OPA3Q9H6K4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
OPA3Q9H6K4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
OPA3Q9H6K4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
OPA3Q9H6K4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
OPA3Q9H6K4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
OPA3Q9H6K4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
OPA3Q9H6K4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
OPA3Q9H6K4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
OPA3Q9H6K4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
OPA3Q9H6K4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
OPA3Q9H6K4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
OPA3Q9H6K4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
OPA3Q9H6K4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
OPA3Q9H6K4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
OPA3Q9H6K4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
OPA3Q9H6K4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
OPA3Q9H6K4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
OPA3Q9H6K4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
OPA3Q9H6K4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
OPA3Q9H6K4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
OPA3Q9H6K4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
OPA3Q9H6K4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
OPA3Q9H6K4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
OPA3Q9H6K4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
OPA3Q9H6K4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
OPA3Q9H6K4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
OPA3Q9H6K4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
OPA3Q9H6K4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
OPA3Q9H6K4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
OPA3Q9H6K4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
OPA3Q9H6K4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
OPA3Q9H6K4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
OPA3Q9H6K4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
OPA3Q9H6K4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
OPA3Q9H6K4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
OPA3Q9H6K4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
OPA3Q9H6K4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
OPA3Q9H6K4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
OPA3Q9H6K4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
OPA3Q9H6K4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
OPA3Q9H6K4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
OPA3Q9H6K4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
OPA3Q9H6K4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
OPA3Q9H6K4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
OPA3Q9H6K4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
OPA3Q9H6K4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
OPA3Q9H6K4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
OPA3Q9H6K4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
OPA3Q9H6K4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
OPA3Q9H6K4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
OPA3Q9H6K4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
OPA3Q9H6K4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
OPA3Q9H6K4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
OPA3Q9H6K4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
OPA3Q9H6K4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
OPA3Q9H6K4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
OPA3Q9H6K4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
OPA3Q9H6K4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
OPA3Q9H6K4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
OPA3Q9H6K4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
OPA3Q9H6K4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
OPA3Q9H6K4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
OPA3Q9H6K4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
OPA3Q9H6K4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
OPA3Q9H6K4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
OPA3Q9H6K4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
OPA3Q9H6K4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
OPA3Q9H6K4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
OPA3Q9H6K4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
OPA3Q9H6K4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
OPA3Q9H6K4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
OPA3Q9H6K4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
OPA3Q9H6K4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
OPA3Q9H6K4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
OPA3Q9H6K4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
OPA3Q9H6K4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
OPA3Q9H6K4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
OPA3Q9H6K4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
OPA3Q9H6K4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
OPA3Q9H6K4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
OPA3Q9H6K4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
OPA3Q9H6K4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
OPA3Q9H6K4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
OPA3Q9H6K4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
OPA3Q9H6K4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
OPA3Q9H6K4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
OPA3Q9H6K4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
OPA3Q9H6K4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
OPA3Q9H6K4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
OPA3Q9H6K4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
OPA3Q9H6K4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
OPA3Q9H6K4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
OPA3Q9H6K4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
OPA3Q9H6K4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
OPA3Q9H6K4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
OPA3Q9H6K4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms