Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2I8

LRMDA, Leucine-rich melanocyte differentiation-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRMDAQ9H2I8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRMDAQ9H2I8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRMDAQ9H2I8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRMDAQ9H2I8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRMDAQ9H2I8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRMDAQ9H2I8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRMDAQ9H2I8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRMDAQ9H2I8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRMDAQ9H2I8 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRMDAQ9H2I8 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LRMDAQ9H2I8 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRMDAQ9H2I8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRMDAQ9H2I8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRMDAQ9H2I8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRMDAQ9H2I8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRMDAQ9H2I8 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRMDAQ9H2I8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRMDAQ9H2I8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRMDAQ9H2I8 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRMDAQ9H2I8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRMDAQ9H2I8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRMDAQ9H2I8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRMDAQ9H2I8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRMDAQ9H2I8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRMDAQ9H2I8 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRMDAQ9H2I8 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRMDAQ9H2I8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRMDAQ9H2I8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRMDAQ9H2I8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRMDAQ9H2I8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRMDAQ9H2I8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRMDAQ9H2I8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRMDAQ9H2I8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRMDAQ9H2I8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRMDAQ9H2I8 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRMDAQ9H2I8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRMDAQ9H2I8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRMDAQ9H2I8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRMDAQ9H2I8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRMDAQ9H2I8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRMDAQ9H2I8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRMDAQ9H2I8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRMDAQ9H2I8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRMDAQ9H2I8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRMDAQ9H2I8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRMDAQ9H2I8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRMDAQ9H2I8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRMDAQ9H2I8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRMDAQ9H2I8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRMDAQ9H2I8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRMDAQ9H2I8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRMDAQ9H2I8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRMDAQ9H2I8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRMDAQ9H2I8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRMDAQ9H2I8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRMDAQ9H2I8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRMDAQ9H2I8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRMDAQ9H2I8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRMDAQ9H2I8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LRMDAQ9H2I8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRMDAQ9H2I8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRMDAQ9H2I8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRMDAQ9H2I8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRMDAQ9H2I8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRMDAQ9H2I8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRMDAQ9H2I8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRMDAQ9H2I8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRMDAQ9H2I8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRMDAQ9H2I8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRMDAQ9H2I8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRMDAQ9H2I8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRMDAQ9H2I8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRMDAQ9H2I8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRMDAQ9H2I8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRMDAQ9H2I8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRMDAQ9H2I8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRMDAQ9H2I8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRMDAQ9H2I8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRMDAQ9H2I8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRMDAQ9H2I8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRMDAQ9H2I8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRMDAQ9H2I8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRMDAQ9H2I8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRMDAQ9H2I8 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LRMDAQ9H2I8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRMDAQ9H2I8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRMDAQ9H2I8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
LRMDAQ9H2I8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
LRMDAQ9H2I8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRMDAQ9H2I8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRMDAQ9H2I8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRMDAQ9H2I8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRMDAQ9H2I8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRMDAQ9H2I8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRMDAQ9H2I8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRMDAQ9H2I8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRMDAQ9H2I8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRMDAQ9H2I8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRMDAQ9H2I8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRMDAQ9H2I8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.4 ms