Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FOXQ1Q9C009 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FOXQ1Q9C009 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
FOXQ1Q9C009 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
FOXQ1Q9C009 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FOXQ1Q9C009 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FOXQ1Q9C009 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FOXQ1Q9C009 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FOXQ1Q9C009 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FOXQ1Q9C009 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FOXQ1Q9C009 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FOXQ1Q9C009 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FOXQ1Q9C009 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
FOXQ1Q9C009 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FOXQ1Q9C009 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FOXQ1Q9C009 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FOXQ1Q9C009 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FOXQ1Q9C009 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FOXQ1Q9C009 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FOXQ1Q9C009 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FOXQ1Q9C009 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FOXQ1Q9C009 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FOXQ1Q9C009 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FOXQ1Q9C009 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FOXQ1Q9C009 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FOXQ1Q9C009 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FOXQ1Q9C009 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FOXQ1Q9C009 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FOXQ1Q9C009 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FOXQ1Q9C009 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FOXQ1Q9C009 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FOXQ1Q9C009 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FOXQ1Q9C009 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FOXQ1Q9C009 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FOXQ1Q9C009 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FOXQ1Q9C009 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
FOXQ1Q9C009 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FOXQ1Q9C009 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FOXQ1Q9C009 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FOXQ1Q9C009 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FOXQ1Q9C009 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FOXQ1Q9C009 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FOXQ1Q9C009 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FOXQ1Q9C009 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FOXQ1Q9C009 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
FOXQ1Q9C009 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FOXQ1Q9C009 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
FOXQ1Q9C009 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
FOXQ1Q9C009 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FOXQ1Q9C009 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
FOXQ1Q9C009 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
FOXQ1Q9C009 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FOXQ1Q9C009 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FOXQ1Q9C009 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FOXQ1Q9C009 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FOXQ1Q9C009 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FOXQ1Q9C009 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FOXQ1Q9C009 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FOXQ1Q9C009 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FOXQ1Q9C009 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FOXQ1Q9C009 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
FOXQ1Q9C009 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
FOXQ1Q9C009 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FOXQ1Q9C009 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FOXQ1Q9C009 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
FOXQ1Q9C009 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FOXQ1Q9C009 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
FOXQ1Q9C009 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FOXQ1Q9C009 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FOXQ1Q9C009 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FOXQ1Q9C009 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FOXQ1Q9C009 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FOXQ1Q9C009 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FOXQ1Q9C009 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
FOXQ1Q9C009 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FOXQ1Q9C009 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FOXQ1Q9C009 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FOXQ1Q9C009 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
FOXQ1Q9C009 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FOXQ1Q9C009 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FOXQ1Q9C009 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
FOXQ1Q9C009 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FOXQ1Q9C009 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FOXQ1Q9C009 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
FOXQ1Q9C009 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FOXQ1Q9C009 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FOXQ1Q9C009 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FOXQ1Q9C009 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
FOXQ1Q9C009 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
FOXQ1Q9C009 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FOXQ1Q9C009 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FOXQ1Q9C009 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FOXQ1Q9C009 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FOXQ1Q9C009 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FOXQ1Q9C009 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FOXQ1Q9C009 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FOXQ1Q9C009 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FOXQ1Q9C009 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
FOXQ1Q9C009 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FOXQ1Q9C009 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms