Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KATNB1Q9BVA0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KATNB1Q9BVA0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KATNB1Q9BVA0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KATNB1Q9BVA0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KATNB1Q9BVA0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KATNB1Q9BVA0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KATNB1Q9BVA0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KATNB1Q9BVA0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KATNB1Q9BVA0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KATNB1Q9BVA0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KATNB1Q9BVA0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KATNB1Q9BVA0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KATNB1Q9BVA0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KATNB1Q9BVA0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KATNB1Q9BVA0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KATNB1Q9BVA0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KATNB1Q9BVA0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
KATNB1Q9BVA0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KATNB1Q9BVA0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KATNB1Q9BVA0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KATNB1Q9BVA0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KATNB1Q9BVA0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KATNB1Q9BVA0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KATNB1Q9BVA0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KATNB1Q9BVA0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KATNB1Q9BVA0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
KATNB1Q9BVA0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KATNB1Q9BVA0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KATNB1Q9BVA0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KATNB1Q9BVA0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KATNB1Q9BVA0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KATNB1Q9BVA0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KATNB1Q9BVA0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KATNB1Q9BVA0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KATNB1Q9BVA0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KATNB1Q9BVA0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
KATNB1Q9BVA0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KATNB1Q9BVA0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KATNB1Q9BVA0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
KATNB1Q9BVA0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KATNB1Q9BVA0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KATNB1Q9BVA0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KATNB1Q9BVA0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KATNB1Q9BVA0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KATNB1Q9BVA0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KATNB1Q9BVA0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KATNB1Q9BVA0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
KATNB1Q9BVA0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KATNB1Q9BVA0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KATNB1Q9BVA0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KATNB1Q9BVA0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KATNB1Q9BVA0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KATNB1Q9BVA0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KATNB1Q9BVA0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KATNB1Q9BVA0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KATNB1Q9BVA0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KATNB1Q9BVA0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KATNB1Q9BVA0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KATNB1Q9BVA0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KATNB1Q9BVA0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KATNB1Q9BVA0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KATNB1Q9BVA0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KATNB1Q9BVA0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KATNB1Q9BVA0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KATNB1Q9BVA0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KATNB1Q9BVA0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KATNB1Q9BVA0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KATNB1Q9BVA0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KATNB1Q9BVA0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KATNB1Q9BVA0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KATNB1Q9BVA0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KATNB1Q9BVA0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KATNB1Q9BVA0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KATNB1Q9BVA0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KATNB1Q9BVA0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KATNB1Q9BVA0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KATNB1Q9BVA0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
KATNB1Q9BVA0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KATNB1Q9BVA0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KATNB1Q9BVA0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KATNB1Q9BVA0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KATNB1Q9BVA0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KATNB1Q9BVA0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KATNB1Q9BVA0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KATNB1Q9BVA0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KATNB1Q9BVA0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KATNB1Q9BVA0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KATNB1Q9BVA0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KATNB1Q9BVA0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KATNB1Q9BVA0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KATNB1Q9BVA0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KATNB1Q9BVA0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KATNB1Q9BVA0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
KATNB1Q9BVA0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
KATNB1Q9BVA0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KATNB1Q9BVA0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KATNB1Q9BVA0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KATNB1Q9BVA0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KATNB1Q9BVA0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms