Protein–RNA interactions for Protein: Q99732

LITAF, Lipopolysaccharide-induced tumor necrosis factor-alpha factor, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LITAFQ99732 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LITAFQ99732 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LITAFQ99732 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LITAFQ99732 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LITAFQ99732 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LITAFQ99732 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LITAFQ99732 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LITAFQ99732 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LITAFQ99732 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LITAFQ99732 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LITAFQ99732 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LITAFQ99732 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LITAFQ99732 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LITAFQ99732 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LITAFQ99732 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LITAFQ99732 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LITAFQ99732 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LITAFQ99732 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LITAFQ99732 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LITAFQ99732 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LITAFQ99732 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LITAFQ99732 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LITAFQ99732 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LITAFQ99732 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LITAFQ99732 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LITAFQ99732 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LITAFQ99732 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LITAFQ99732 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LITAFQ99732 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LITAFQ99732 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LITAFQ99732 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LITAFQ99732 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LITAFQ99732 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LITAFQ99732 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LITAFQ99732 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LITAFQ99732 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LITAFQ99732 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LITAFQ99732 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LITAFQ99732 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LITAFQ99732 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LITAFQ99732 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LITAFQ99732 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LITAFQ99732 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LITAFQ99732 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LITAFQ99732 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LITAFQ99732 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LITAFQ99732 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LITAFQ99732 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LITAFQ99732 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LITAFQ99732 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LITAFQ99732 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LITAFQ99732 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LITAFQ99732 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LITAFQ99732 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LITAFQ99732 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LITAFQ99732 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LITAFQ99732 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LITAFQ99732 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
LITAFQ99732 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LITAFQ99732 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LITAFQ99732 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LITAFQ99732 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LITAFQ99732 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LITAFQ99732 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LITAFQ99732 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LITAFQ99732 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LITAFQ99732 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LITAFQ99732 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
LITAFQ99732 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LITAFQ99732 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LITAFQ99732 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LITAFQ99732 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LITAFQ99732 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LITAFQ99732 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LITAFQ99732 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LITAFQ99732 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LITAFQ99732 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LITAFQ99732 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LITAFQ99732 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LITAFQ99732 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LITAFQ99732 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LITAFQ99732 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LITAFQ99732 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LITAFQ99732 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LITAFQ99732 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LITAFQ99732 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LITAFQ99732 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LITAFQ99732 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LITAFQ99732 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LITAFQ99732 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LITAFQ99732 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LITAFQ99732 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LITAFQ99732 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LITAFQ99732 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LITAFQ99732 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LITAFQ99732 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LITAFQ99732 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LITAFQ99732 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LITAFQ99732 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LITAFQ99732 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms