Protein–RNA interactions for Protein: Q99471

PFDN5, Prefoldin subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN5Q99471 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PFDN5Q99471 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PFDN5Q99471 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PFDN5Q99471 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PFDN5Q99471 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PFDN5Q99471 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PFDN5Q99471 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PFDN5Q99471 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PFDN5Q99471 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PFDN5Q99471 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PFDN5Q99471 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PFDN5Q99471 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PFDN5Q99471 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PFDN5Q99471 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PFDN5Q99471 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PFDN5Q99471 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PFDN5Q99471 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PFDN5Q99471 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PFDN5Q99471 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PFDN5Q99471 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PFDN5Q99471 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PFDN5Q99471 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PFDN5Q99471 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PFDN5Q99471 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PFDN5Q99471 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PFDN5Q99471 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PFDN5Q99471 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PFDN5Q99471 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PFDN5Q99471 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PFDN5Q99471 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PFDN5Q99471 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PFDN5Q99471 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PFDN5Q99471 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PFDN5Q99471 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PFDN5Q99471 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PFDN5Q99471 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PFDN5Q99471 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PFDN5Q99471 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PFDN5Q99471 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PFDN5Q99471 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PFDN5Q99471 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PFDN5Q99471 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PFDN5Q99471 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PFDN5Q99471 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PFDN5Q99471 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PFDN5Q99471 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PFDN5Q99471 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PFDN5Q99471 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PFDN5Q99471 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PFDN5Q99471 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PFDN5Q99471 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PFDN5Q99471 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PFDN5Q99471 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PFDN5Q99471 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PFDN5Q99471 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PFDN5Q99471 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PFDN5Q99471 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PFDN5Q99471 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PFDN5Q99471 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PFDN5Q99471 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PFDN5Q99471 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PFDN5Q99471 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PFDN5Q99471 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PFDN5Q99471 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PFDN5Q99471 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PFDN5Q99471 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PFDN5Q99471 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PFDN5Q99471 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PFDN5Q99471 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PFDN5Q99471 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PFDN5Q99471 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PFDN5Q99471 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PFDN5Q99471 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PFDN5Q99471 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PFDN5Q99471 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PFDN5Q99471 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PFDN5Q99471 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PFDN5Q99471 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PFDN5Q99471 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PFDN5Q99471 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PFDN5Q99471 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PFDN5Q99471 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PFDN5Q99471 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PFDN5Q99471 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PFDN5Q99471 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PFDN5Q99471 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PFDN5Q99471 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PFDN5Q99471 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PFDN5Q99471 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PFDN5Q99471 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PFDN5Q99471 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PFDN5Q99471 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PFDN5Q99471 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PFDN5Q99471 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PFDN5Q99471 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PFDN5Q99471 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PFDN5Q99471 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PFDN5Q99471 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PFDN5Q99471 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PFDN5Q99471 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms