Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD5

DEPDC7, DEP domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPDC7Q96QD5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DEPDC7Q96QD5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DEPDC7Q96QD5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
DEPDC7Q96QD5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DEPDC7Q96QD5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DEPDC7Q96QD5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DEPDC7Q96QD5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DEPDC7Q96QD5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
DEPDC7Q96QD5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DEPDC7Q96QD5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DEPDC7Q96QD5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DEPDC7Q96QD5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DEPDC7Q96QD5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DEPDC7Q96QD5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DEPDC7Q96QD5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DEPDC7Q96QD5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DEPDC7Q96QD5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DEPDC7Q96QD5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DEPDC7Q96QD5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DEPDC7Q96QD5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DEPDC7Q96QD5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DEPDC7Q96QD5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
DEPDC7Q96QD5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DEPDC7Q96QD5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DEPDC7Q96QD5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DEPDC7Q96QD5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DEPDC7Q96QD5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DEPDC7Q96QD5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
DEPDC7Q96QD5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DEPDC7Q96QD5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DEPDC7Q96QD5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DEPDC7Q96QD5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
DEPDC7Q96QD5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DEPDC7Q96QD5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DEPDC7Q96QD5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DEPDC7Q96QD5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DEPDC7Q96QD5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
DEPDC7Q96QD5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DEPDC7Q96QD5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DEPDC7Q96QD5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DEPDC7Q96QD5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DEPDC7Q96QD5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DEPDC7Q96QD5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DEPDC7Q96QD5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DEPDC7Q96QD5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
DEPDC7Q96QD5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DEPDC7Q96QD5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DEPDC7Q96QD5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
DEPDC7Q96QD5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DEPDC7Q96QD5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DEPDC7Q96QD5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DEPDC7Q96QD5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DEPDC7Q96QD5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DEPDC7Q96QD5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DEPDC7Q96QD5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DEPDC7Q96QD5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DEPDC7Q96QD5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DEPDC7Q96QD5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DEPDC7Q96QD5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
DEPDC7Q96QD5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DEPDC7Q96QD5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
DEPDC7Q96QD5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DEPDC7Q96QD5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DEPDC7Q96QD5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
DEPDC7Q96QD5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DEPDC7Q96QD5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DEPDC7Q96QD5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DEPDC7Q96QD5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DEPDC7Q96QD5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DEPDC7Q96QD5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DEPDC7Q96QD5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DEPDC7Q96QD5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DEPDC7Q96QD5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DEPDC7Q96QD5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DEPDC7Q96QD5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DEPDC7Q96QD5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DEPDC7Q96QD5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DEPDC7Q96QD5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DEPDC7Q96QD5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
DEPDC7Q96QD5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DEPDC7Q96QD5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DEPDC7Q96QD5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DEPDC7Q96QD5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DEPDC7Q96QD5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DEPDC7Q96QD5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DEPDC7Q96QD5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DEPDC7Q96QD5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DEPDC7Q96QD5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DEPDC7Q96QD5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DEPDC7Q96QD5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DEPDC7Q96QD5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DEPDC7Q96QD5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DEPDC7Q96QD5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
DEPDC7Q96QD5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DEPDC7Q96QD5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DEPDC7Q96QD5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DEPDC7Q96QD5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DEPDC7Q96QD5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
DEPDC7Q96QD5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DEPDC7Q96QD5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.3 ms