Protein–RNA interactions for Protein: Q96MT4

LINC01600, Uncharacterized protein encoded by LINC01600, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01600Q96MT4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC01600Q96MT4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC01600Q96MT4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC01600Q96MT4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC01600Q96MT4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC01600Q96MT4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC01600Q96MT4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC01600Q96MT4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC01600Q96MT4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC01600Q96MT4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC01600Q96MT4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC01600Q96MT4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC01600Q96MT4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC01600Q96MT4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC01600Q96MT4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC01600Q96MT4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC01600Q96MT4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC01600Q96MT4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC01600Q96MT4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC01600Q96MT4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC01600Q96MT4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC01600Q96MT4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC01600Q96MT4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC01600Q96MT4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC01600Q96MT4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC01600Q96MT4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC01600Q96MT4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC01600Q96MT4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC01600Q96MT4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC01600Q96MT4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC01600Q96MT4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC01600Q96MT4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC01600Q96MT4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC01600Q96MT4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC01600Q96MT4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC01600Q96MT4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC01600Q96MT4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC01600Q96MT4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC01600Q96MT4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC01600Q96MT4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
LINC01600Q96MT4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC01600Q96MT4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC01600Q96MT4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC01600Q96MT4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC01600Q96MT4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC01600Q96MT4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC01600Q96MT4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC01600Q96MT4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC01600Q96MT4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC01600Q96MT4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC01600Q96MT4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC01600Q96MT4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC01600Q96MT4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC01600Q96MT4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC01600Q96MT4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC01600Q96MT4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC01600Q96MT4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC01600Q96MT4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC01600Q96MT4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC01600Q96MT4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC01600Q96MT4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC01600Q96MT4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC01600Q96MT4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC01600Q96MT4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC01600Q96MT4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC01600Q96MT4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC01600Q96MT4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC01600Q96MT4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC01600Q96MT4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC01600Q96MT4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC01600Q96MT4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC01600Q96MT4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC01600Q96MT4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC01600Q96MT4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC01600Q96MT4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC01600Q96MT4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC01600Q96MT4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC01600Q96MT4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
LINC01600Q96MT4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC01600Q96MT4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC01600Q96MT4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC01600Q96MT4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC01600Q96MT4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC01600Q96MT4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC01600Q96MT4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC01600Q96MT4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC01600Q96MT4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC01600Q96MT4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC01600Q96MT4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC01600Q96MT4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC01600Q96MT4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC01600Q96MT4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC01600Q96MT4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC01600Q96MT4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC01600Q96MT4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC01600Q96MT4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC01600Q96MT4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC01600Q96MT4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC01600Q96MT4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC01600Q96MT4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms