Protein–RNA interactions for Protein: Q96LS8

C2orf48, Uncharacterized protein C2orf48, humanhuman

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf48Q96LS8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
C2orf48Q96LS8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C2orf48Q96LS8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C2orf48Q96LS8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C2orf48Q96LS8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C2orf48Q96LS8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C2orf48Q96LS8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C2orf48Q96LS8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C2orf48Q96LS8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
C2orf48Q96LS8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C2orf48Q96LS8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C2orf48Q96LS8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C2orf48Q96LS8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C2orf48Q96LS8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C2orf48Q96LS8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
C2orf48Q96LS8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C2orf48Q96LS8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C2orf48Q96LS8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C2orf48Q96LS8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C2orf48Q96LS8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C2orf48Q96LS8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C2orf48Q96LS8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C2orf48Q96LS8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
C2orf48Q96LS8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C2orf48Q96LS8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C2orf48Q96LS8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C2orf48Q96LS8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C2orf48Q96LS8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C2orf48Q96LS8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C2orf48Q96LS8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
C2orf48Q96LS8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C2orf48Q96LS8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C2orf48Q96LS8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C2orf48Q96LS8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C2orf48Q96LS8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C2orf48Q96LS8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
C2orf48Q96LS8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C2orf48Q96LS8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C2orf48Q96LS8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C2orf48Q96LS8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
C2orf48Q96LS8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C2orf48Q96LS8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C2orf48Q96LS8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C2orf48Q96LS8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C2orf48Q96LS8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C2orf48Q96LS8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C2orf48Q96LS8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C2orf48Q96LS8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
C2orf48Q96LS8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C2orf48Q96LS8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C2orf48Q96LS8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C2orf48Q96LS8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C2orf48Q96LS8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C2orf48Q96LS8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C2orf48Q96LS8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C2orf48Q96LS8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C2orf48Q96LS8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C2orf48Q96LS8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C2orf48Q96LS8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C2orf48Q96LS8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C2orf48Q96LS8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C2orf48Q96LS8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C2orf48Q96LS8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C2orf48Q96LS8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C2orf48Q96LS8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C2orf48Q96LS8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C2orf48Q96LS8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C2orf48Q96LS8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C2orf48Q96LS8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
C2orf48Q96LS8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C2orf48Q96LS8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C2orf48Q96LS8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C2orf48Q96LS8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C2orf48Q96LS8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C2orf48Q96LS8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C2orf48Q96LS8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C2orf48Q96LS8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C2orf48Q96LS8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C2orf48Q96LS8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C2orf48Q96LS8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C2orf48Q96LS8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C2orf48Q96LS8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C2orf48Q96LS8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C2orf48Q96LS8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C2orf48Q96LS8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C2orf48Q96LS8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C2orf48Q96LS8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C2orf48Q96LS8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C2orf48Q96LS8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C2orf48Q96LS8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
C2orf48Q96LS8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C2orf48Q96LS8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C2orf48Q96LS8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C2orf48Q96LS8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C2orf48Q96LS8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C2orf48Q96LS8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C2orf48Q96LS8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C2orf48Q96LS8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C2orf48Q96LS8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C2orf48Q96LS8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
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