Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
CAPNS2Q96L46 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
CAPNS2Q96L46 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
CAPNS2Q96L46 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
CAPNS2Q96L46 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CAPNS2Q96L46 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CAPNS2Q96L46 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CAPNS2Q96L46 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CAPNS2Q96L46 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
CAPNS2Q96L46 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CAPNS2Q96L46 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CAPNS2Q96L46 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
CAPNS2Q96L46 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CAPNS2Q96L46 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
CAPNS2Q96L46 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CAPNS2Q96L46 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CAPNS2Q96L46 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CAPNS2Q96L46 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CAPNS2Q96L46 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CAPNS2Q96L46 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
CAPNS2Q96L46 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CAPNS2Q96L46 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CAPNS2Q96L46 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CAPNS2Q96L46 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CAPNS2Q96L46 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CAPNS2Q96L46 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CAPNS2Q96L46 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CAPNS2Q96L46 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
CAPNS2Q96L46 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CAPNS2Q96L46 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
CAPNS2Q96L46 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CAPNS2Q96L46 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
CAPNS2Q96L46 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CAPNS2Q96L46 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CAPNS2Q96L46 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CAPNS2Q96L46 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
CAPNS2Q96L46 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CAPNS2Q96L46 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CAPNS2Q96L46 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CAPNS2Q96L46 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
CAPNS2Q96L46 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CAPNS2Q96L46 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
CAPNS2Q96L46 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CAPNS2Q96L46 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CAPNS2Q96L46 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
CAPNS2Q96L46 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CAPNS2Q96L46 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CAPNS2Q96L46 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
CAPNS2Q96L46 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CAPNS2Q96L46 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
CAPNS2Q96L46 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CAPNS2Q96L46 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CAPNS2Q96L46 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CAPNS2Q96L46 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CAPNS2Q96L46 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CAPNS2Q96L46 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CAPNS2Q96L46 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CAPNS2Q96L46 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CAPNS2Q96L46 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CAPNS2Q96L46 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CAPNS2Q96L46 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CAPNS2Q96L46 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CAPNS2Q96L46 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
CAPNS2Q96L46 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CAPNS2Q96L46 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CAPNS2Q96L46 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CAPNS2Q96L46 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CAPNS2Q96L46 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CAPNS2Q96L46 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CAPNS2Q96L46 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CAPNS2Q96L46 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CAPNS2Q96L46 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CAPNS2Q96L46 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CAPNS2Q96L46 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CAPNS2Q96L46 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CAPNS2Q96L46 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CAPNS2Q96L46 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CAPNS2Q96L46 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
CAPNS2Q96L46 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CAPNS2Q96L46 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CAPNS2Q96L46 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CAPNS2Q96L46 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CAPNS2Q96L46 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CAPNS2Q96L46 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CAPNS2Q96L46 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CAPNS2Q96L46 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
CAPNS2Q96L46 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CAPNS2Q96L46 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
CAPNS2Q96L46 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CAPNS2Q96L46 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CAPNS2Q96L46 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
CAPNS2Q96L46 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CAPNS2Q96L46 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CAPNS2Q96L46 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CAPNS2Q96L46 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
CAPNS2Q96L46 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CAPNS2Q96L46 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
CAPNS2Q96L46 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CAPNS2Q96L46 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CAPNS2Q96L46 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms