Protein–RNA interactions for Protein: Q96KC9

CABS1, Calcium-binding and spermatid-specific protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABS1Q96KC9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CABS1Q96KC9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CABS1Q96KC9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
CABS1Q96KC9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CABS1Q96KC9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CABS1Q96KC9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CABS1Q96KC9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CABS1Q96KC9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CABS1Q96KC9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CABS1Q96KC9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CABS1Q96KC9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CABS1Q96KC9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CABS1Q96KC9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CABS1Q96KC9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CABS1Q96KC9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CABS1Q96KC9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CABS1Q96KC9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CABS1Q96KC9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CABS1Q96KC9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CABS1Q96KC9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CABS1Q96KC9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CABS1Q96KC9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CABS1Q96KC9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CABS1Q96KC9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CABS1Q96KC9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CABS1Q96KC9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CABS1Q96KC9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CABS1Q96KC9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CABS1Q96KC9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CABS1Q96KC9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CABS1Q96KC9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CABS1Q96KC9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CABS1Q96KC9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CABS1Q96KC9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CABS1Q96KC9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CABS1Q96KC9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CABS1Q96KC9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CABS1Q96KC9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CABS1Q96KC9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CABS1Q96KC9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CABS1Q96KC9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CABS1Q96KC9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CABS1Q96KC9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CABS1Q96KC9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CABS1Q96KC9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CABS1Q96KC9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CABS1Q96KC9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CABS1Q96KC9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CABS1Q96KC9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CABS1Q96KC9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CABS1Q96KC9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CABS1Q96KC9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CABS1Q96KC9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CABS1Q96KC9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CABS1Q96KC9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CABS1Q96KC9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CABS1Q96KC9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CABS1Q96KC9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CABS1Q96KC9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CABS1Q96KC9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CABS1Q96KC9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CABS1Q96KC9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CABS1Q96KC9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CABS1Q96KC9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CABS1Q96KC9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CABS1Q96KC9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CABS1Q96KC9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CABS1Q96KC9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CABS1Q96KC9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CABS1Q96KC9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CABS1Q96KC9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CABS1Q96KC9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CABS1Q96KC9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CABS1Q96KC9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CABS1Q96KC9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CABS1Q96KC9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CABS1Q96KC9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CABS1Q96KC9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CABS1Q96KC9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CABS1Q96KC9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CABS1Q96KC9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CABS1Q96KC9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CABS1Q96KC9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CABS1Q96KC9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CABS1Q96KC9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CABS1Q96KC9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CABS1Q96KC9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CABS1Q96KC9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CABS1Q96KC9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CABS1Q96KC9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CABS1Q96KC9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CABS1Q96KC9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CABS1Q96KC9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CABS1Q96KC9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CABS1Q96KC9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CABS1Q96KC9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CABS1Q96KC9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CABS1Q96KC9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CABS1Q96KC9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CABS1Q96KC9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms