Protein–RNA interactions for Protein: Q96IY1

NSL1, Kinetochore-associated protein NSL1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSL1Q96IY1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NSL1Q96IY1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NSL1Q96IY1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NSL1Q96IY1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NSL1Q96IY1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NSL1Q96IY1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NSL1Q96IY1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NSL1Q96IY1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NSL1Q96IY1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NSL1Q96IY1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NSL1Q96IY1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NSL1Q96IY1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NSL1Q96IY1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NSL1Q96IY1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NSL1Q96IY1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NSL1Q96IY1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NSL1Q96IY1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NSL1Q96IY1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NSL1Q96IY1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NSL1Q96IY1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NSL1Q96IY1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NSL1Q96IY1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NSL1Q96IY1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NSL1Q96IY1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NSL1Q96IY1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NSL1Q96IY1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NSL1Q96IY1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NSL1Q96IY1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NSL1Q96IY1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NSL1Q96IY1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NSL1Q96IY1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NSL1Q96IY1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NSL1Q96IY1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NSL1Q96IY1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NSL1Q96IY1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NSL1Q96IY1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NSL1Q96IY1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NSL1Q96IY1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NSL1Q96IY1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NSL1Q96IY1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NSL1Q96IY1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NSL1Q96IY1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NSL1Q96IY1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NSL1Q96IY1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NSL1Q96IY1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NSL1Q96IY1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NSL1Q96IY1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NSL1Q96IY1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NSL1Q96IY1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NSL1Q96IY1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NSL1Q96IY1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NSL1Q96IY1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NSL1Q96IY1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NSL1Q96IY1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NSL1Q96IY1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NSL1Q96IY1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NSL1Q96IY1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NSL1Q96IY1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NSL1Q96IY1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NSL1Q96IY1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NSL1Q96IY1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NSL1Q96IY1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NSL1Q96IY1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NSL1Q96IY1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NSL1Q96IY1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NSL1Q96IY1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NSL1Q96IY1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NSL1Q96IY1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NSL1Q96IY1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NSL1Q96IY1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NSL1Q96IY1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NSL1Q96IY1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NSL1Q96IY1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NSL1Q96IY1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NSL1Q96IY1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NSL1Q96IY1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NSL1Q96IY1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NSL1Q96IY1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NSL1Q96IY1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NSL1Q96IY1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NSL1Q96IY1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NSL1Q96IY1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NSL1Q96IY1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NSL1Q96IY1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NSL1Q96IY1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NSL1Q96IY1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NSL1Q96IY1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NSL1Q96IY1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NSL1Q96IY1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NSL1Q96IY1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NSL1Q96IY1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NSL1Q96IY1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NSL1Q96IY1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NSL1Q96IY1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NSL1Q96IY1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NSL1Q96IY1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NSL1Q96IY1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NSL1Q96IY1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NSL1Q96IY1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NSL1Q96IY1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms