Protein–RNA interactions for Protein: Q96HS1

PGAM5, Serine/threonine-protein phosphatase PGAM5, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAM5Q96HS1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGAM5Q96HS1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PGAM5Q96HS1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGAM5Q96HS1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGAM5Q96HS1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PGAM5Q96HS1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PGAM5Q96HS1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGAM5Q96HS1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGAM5Q96HS1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGAM5Q96HS1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGAM5Q96HS1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGAM5Q96HS1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGAM5Q96HS1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PGAM5Q96HS1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PGAM5Q96HS1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGAM5Q96HS1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGAM5Q96HS1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGAM5Q96HS1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGAM5Q96HS1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGAM5Q96HS1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGAM5Q96HS1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGAM5Q96HS1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PGAM5Q96HS1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGAM5Q96HS1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGAM5Q96HS1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGAM5Q96HS1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGAM5Q96HS1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGAM5Q96HS1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGAM5Q96HS1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGAM5Q96HS1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PGAM5Q96HS1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGAM5Q96HS1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGAM5Q96HS1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PGAM5Q96HS1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGAM5Q96HS1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGAM5Q96HS1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGAM5Q96HS1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGAM5Q96HS1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGAM5Q96HS1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGAM5Q96HS1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGAM5Q96HS1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGAM5Q96HS1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGAM5Q96HS1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGAM5Q96HS1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGAM5Q96HS1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGAM5Q96HS1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGAM5Q96HS1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGAM5Q96HS1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGAM5Q96HS1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGAM5Q96HS1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGAM5Q96HS1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGAM5Q96HS1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGAM5Q96HS1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGAM5Q96HS1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGAM5Q96HS1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGAM5Q96HS1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGAM5Q96HS1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGAM5Q96HS1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGAM5Q96HS1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGAM5Q96HS1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGAM5Q96HS1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGAM5Q96HS1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGAM5Q96HS1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGAM5Q96HS1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGAM5Q96HS1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PGAM5Q96HS1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PGAM5Q96HS1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGAM5Q96HS1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGAM5Q96HS1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGAM5Q96HS1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGAM5Q96HS1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGAM5Q96HS1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PGAM5Q96HS1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PGAM5Q96HS1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PGAM5Q96HS1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PGAM5Q96HS1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PGAM5Q96HS1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PGAM5Q96HS1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PGAM5Q96HS1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PGAM5Q96HS1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PGAM5Q96HS1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PGAM5Q96HS1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PGAM5Q96HS1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PGAM5Q96HS1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PGAM5Q96HS1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PGAM5Q96HS1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PGAM5Q96HS1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PGAM5Q96HS1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PGAM5Q96HS1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PGAM5Q96HS1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PGAM5Q96HS1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PGAM5Q96HS1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PGAM5Q96HS1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PGAM5Q96HS1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PGAM5Q96HS1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PGAM5Q96HS1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PGAM5Q96HS1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PGAM5Q96HS1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PGAM5Q96HS1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PGAM5Q96HS1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms