Protein–RNA interactions for Protein: Q96HC4

PDLIM5, PDZ and LIM domain protein 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM5Q96HC4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDLIM5Q96HC4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDLIM5Q96HC4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDLIM5Q96HC4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDLIM5Q96HC4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDLIM5Q96HC4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDLIM5Q96HC4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PDLIM5Q96HC4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDLIM5Q96HC4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDLIM5Q96HC4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDLIM5Q96HC4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PDLIM5Q96HC4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDLIM5Q96HC4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDLIM5Q96HC4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDLIM5Q96HC4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDLIM5Q96HC4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDLIM5Q96HC4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDLIM5Q96HC4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDLIM5Q96HC4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDLIM5Q96HC4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDLIM5Q96HC4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PDLIM5Q96HC4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PDLIM5Q96HC4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PDLIM5Q96HC4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDLIM5Q96HC4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDLIM5Q96HC4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDLIM5Q96HC4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDLIM5Q96HC4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDLIM5Q96HC4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDLIM5Q96HC4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDLIM5Q96HC4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDLIM5Q96HC4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDLIM5Q96HC4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDLIM5Q96HC4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDLIM5Q96HC4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDLIM5Q96HC4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDLIM5Q96HC4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDLIM5Q96HC4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDLIM5Q96HC4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDLIM5Q96HC4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDLIM5Q96HC4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDLIM5Q96HC4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDLIM5Q96HC4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PDLIM5Q96HC4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDLIM5Q96HC4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDLIM5Q96HC4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PDLIM5Q96HC4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDLIM5Q96HC4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDLIM5Q96HC4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDLIM5Q96HC4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDLIM5Q96HC4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDLIM5Q96HC4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDLIM5Q96HC4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDLIM5Q96HC4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDLIM5Q96HC4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDLIM5Q96HC4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDLIM5Q96HC4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDLIM5Q96HC4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDLIM5Q96HC4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDLIM5Q96HC4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDLIM5Q96HC4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDLIM5Q96HC4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDLIM5Q96HC4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDLIM5Q96HC4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDLIM5Q96HC4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDLIM5Q96HC4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDLIM5Q96HC4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDLIM5Q96HC4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDLIM5Q96HC4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PDLIM5Q96HC4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDLIM5Q96HC4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDLIM5Q96HC4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDLIM5Q96HC4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDLIM5Q96HC4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDLIM5Q96HC4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDLIM5Q96HC4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDLIM5Q96HC4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDLIM5Q96HC4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDLIM5Q96HC4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDLIM5Q96HC4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDLIM5Q96HC4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDLIM5Q96HC4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDLIM5Q96HC4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDLIM5Q96HC4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDLIM5Q96HC4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDLIM5Q96HC4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDLIM5Q96HC4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDLIM5Q96HC4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDLIM5Q96HC4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDLIM5Q96HC4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDLIM5Q96HC4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDLIM5Q96HC4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDLIM5Q96HC4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PDLIM5Q96HC4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PDLIM5Q96HC4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PDLIM5Q96HC4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDLIM5Q96HC4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDLIM5Q96HC4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDLIM5Q96HC4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDLIM5Q96HC4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms