Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UTP4Q969X6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
UTP4Q969X6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
UTP4Q969X6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UTP4Q969X6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UTP4Q969X6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UTP4Q969X6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UTP4Q969X6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UTP4Q969X6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UTP4Q969X6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UTP4Q969X6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UTP4Q969X6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UTP4Q969X6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UTP4Q969X6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UTP4Q969X6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UTP4Q969X6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UTP4Q969X6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UTP4Q969X6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UTP4Q969X6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UTP4Q969X6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UTP4Q969X6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UTP4Q969X6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UTP4Q969X6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UTP4Q969X6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UTP4Q969X6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UTP4Q969X6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UTP4Q969X6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UTP4Q969X6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UTP4Q969X6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UTP4Q969X6 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UTP4Q969X6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UTP4Q969X6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UTP4Q969X6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UTP4Q969X6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UTP4Q969X6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UTP4Q969X6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UTP4Q969X6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UTP4Q969X6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UTP4Q969X6 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UTP4Q969X6 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UTP4Q969X6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UTP4Q969X6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UTP4Q969X6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UTP4Q969X6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UTP4Q969X6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UTP4Q969X6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UTP4Q969X6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UTP4Q969X6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UTP4Q969X6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UTP4Q969X6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UTP4Q969X6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UTP4Q969X6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UTP4Q969X6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UTP4Q969X6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UTP4Q969X6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UTP4Q969X6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UTP4Q969X6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UTP4Q969X6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UTP4Q969X6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UTP4Q969X6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UTP4Q969X6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UTP4Q969X6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UTP4Q969X6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UTP4Q969X6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UTP4Q969X6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UTP4Q969X6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UTP4Q969X6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UTP4Q969X6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UTP4Q969X6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UTP4Q969X6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UTP4Q969X6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UTP4Q969X6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
UTP4Q969X6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
UTP4Q969X6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UTP4Q969X6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UTP4Q969X6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UTP4Q969X6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UTP4Q969X6 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UTP4Q969X6 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
UTP4Q969X6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
UTP4Q969X6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UTP4Q969X6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UTP4Q969X6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
UTP4Q969X6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UTP4Q969X6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UTP4Q969X6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UTP4Q969X6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UTP4Q969X6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UTP4Q969X6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UTP4Q969X6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UTP4Q969X6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UTP4Q969X6 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UTP4Q969X6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UTP4Q969X6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UTP4Q969X6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UTP4Q969X6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UTP4Q969X6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
UTP4Q969X6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UTP4Q969X6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UTP4Q969X6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms