Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPTSSAQ969W0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPTSSAQ969W0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPTSSAQ969W0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPTSSAQ969W0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPTSSAQ969W0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPTSSAQ969W0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPTSSAQ969W0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPTSSAQ969W0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPTSSAQ969W0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPTSSAQ969W0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPTSSAQ969W0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPTSSAQ969W0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPTSSAQ969W0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPTSSAQ969W0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPTSSAQ969W0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPTSSAQ969W0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPTSSAQ969W0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SPTSSAQ969W0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPTSSAQ969W0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPTSSAQ969W0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPTSSAQ969W0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SPTSSAQ969W0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPTSSAQ969W0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPTSSAQ969W0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPTSSAQ969W0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPTSSAQ969W0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPTSSAQ969W0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPTSSAQ969W0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPTSSAQ969W0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPTSSAQ969W0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPTSSAQ969W0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPTSSAQ969W0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPTSSAQ969W0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPTSSAQ969W0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPTSSAQ969W0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPTSSAQ969W0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SPTSSAQ969W0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPTSSAQ969W0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPTSSAQ969W0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SPTSSAQ969W0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPTSSAQ969W0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPTSSAQ969W0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPTSSAQ969W0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPTSSAQ969W0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPTSSAQ969W0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPTSSAQ969W0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPTSSAQ969W0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPTSSAQ969W0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPTSSAQ969W0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPTSSAQ969W0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPTSSAQ969W0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPTSSAQ969W0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPTSSAQ969W0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPTSSAQ969W0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPTSSAQ969W0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPTSSAQ969W0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPTSSAQ969W0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPTSSAQ969W0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPTSSAQ969W0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPTSSAQ969W0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPTSSAQ969W0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPTSSAQ969W0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPTSSAQ969W0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SPTSSAQ969W0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPTSSAQ969W0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPTSSAQ969W0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPTSSAQ969W0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPTSSAQ969W0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPTSSAQ969W0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPTSSAQ969W0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPTSSAQ969W0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPTSSAQ969W0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPTSSAQ969W0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPTSSAQ969W0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPTSSAQ969W0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SPTSSAQ969W0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SPTSSAQ969W0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPTSSAQ969W0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPTSSAQ969W0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPTSSAQ969W0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPTSSAQ969W0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SPTSSAQ969W0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPTSSAQ969W0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SPTSSAQ969W0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPTSSAQ969W0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SPTSSAQ969W0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPTSSAQ969W0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPTSSAQ969W0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPTSSAQ969W0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPTSSAQ969W0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPTSSAQ969W0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SPTSSAQ969W0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPTSSAQ969W0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPTSSAQ969W0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPTSSAQ969W0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPTSSAQ969W0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPTSSAQ969W0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPTSSAQ969W0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPTSSAQ969W0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 198.2 ms