Protein–RNA interactions for Protein: Q969V3

NCLN, Nicalin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCLNQ969V3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCLNQ969V3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCLNQ969V3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCLNQ969V3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCLNQ969V3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCLNQ969V3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCLNQ969V3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCLNQ969V3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCLNQ969V3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCLNQ969V3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NCLNQ969V3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCLNQ969V3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCLNQ969V3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCLNQ969V3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCLNQ969V3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCLNQ969V3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCLNQ969V3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCLNQ969V3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCLNQ969V3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCLNQ969V3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCLNQ969V3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCLNQ969V3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCLNQ969V3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCLNQ969V3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCLNQ969V3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCLNQ969V3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCLNQ969V3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCLNQ969V3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCLNQ969V3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCLNQ969V3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCLNQ969V3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCLNQ969V3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCLNQ969V3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCLNQ969V3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCLNQ969V3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCLNQ969V3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCLNQ969V3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCLNQ969V3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCLNQ969V3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCLNQ969V3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCLNQ969V3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NCLNQ969V3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCLNQ969V3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCLNQ969V3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCLNQ969V3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCLNQ969V3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCLNQ969V3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCLNQ969V3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCLNQ969V3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCLNQ969V3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCLNQ969V3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCLNQ969V3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NCLNQ969V3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCLNQ969V3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCLNQ969V3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCLNQ969V3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCLNQ969V3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCLNQ969V3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCLNQ969V3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCLNQ969V3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCLNQ969V3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NCLNQ969V3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCLNQ969V3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCLNQ969V3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCLNQ969V3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCLNQ969V3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCLNQ969V3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCLNQ969V3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCLNQ969V3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCLNQ969V3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCLNQ969V3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCLNQ969V3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCLNQ969V3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCLNQ969V3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCLNQ969V3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCLNQ969V3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCLNQ969V3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCLNQ969V3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCLNQ969V3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCLNQ969V3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCLNQ969V3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NCLNQ969V3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCLNQ969V3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCLNQ969V3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCLNQ969V3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCLNQ969V3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCLNQ969V3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NCLNQ969V3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NCLNQ969V3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NCLNQ969V3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NCLNQ969V3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NCLNQ969V3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NCLNQ969V3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NCLNQ969V3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NCLNQ969V3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NCLNQ969V3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCLNQ969V3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCLNQ969V3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCLNQ969V3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCLNQ969V3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms