Protein–RNA interactions for Protein: Q92966

SNAPC3, snRNA-activating protein complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC3Q92966 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNAPC3Q92966 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SNAPC3Q92966 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNAPC3Q92966 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNAPC3Q92966 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SNAPC3Q92966 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNAPC3Q92966 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNAPC3Q92966 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNAPC3Q92966 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNAPC3Q92966 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNAPC3Q92966 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNAPC3Q92966 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNAPC3Q92966 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SNAPC3Q92966 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNAPC3Q92966 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNAPC3Q92966 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNAPC3Q92966 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNAPC3Q92966 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNAPC3Q92966 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNAPC3Q92966 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNAPC3Q92966 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNAPC3Q92966 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNAPC3Q92966 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNAPC3Q92966 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNAPC3Q92966 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNAPC3Q92966 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNAPC3Q92966 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNAPC3Q92966 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNAPC3Q92966 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNAPC3Q92966 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNAPC3Q92966 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNAPC3Q92966 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNAPC3Q92966 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNAPC3Q92966 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNAPC3Q92966 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNAPC3Q92966 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNAPC3Q92966 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNAPC3Q92966 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNAPC3Q92966 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNAPC3Q92966 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNAPC3Q92966 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNAPC3Q92966 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNAPC3Q92966 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNAPC3Q92966 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNAPC3Q92966 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNAPC3Q92966 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNAPC3Q92966 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNAPC3Q92966 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SNAPC3Q92966 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNAPC3Q92966 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNAPC3Q92966 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNAPC3Q92966 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNAPC3Q92966 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNAPC3Q92966 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNAPC3Q92966 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNAPC3Q92966 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNAPC3Q92966 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNAPC3Q92966 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SNAPC3Q92966 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNAPC3Q92966 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNAPC3Q92966 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNAPC3Q92966 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNAPC3Q92966 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNAPC3Q92966 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNAPC3Q92966 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNAPC3Q92966 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNAPC3Q92966 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNAPC3Q92966 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNAPC3Q92966 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNAPC3Q92966 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNAPC3Q92966 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNAPC3Q92966 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNAPC3Q92966 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNAPC3Q92966 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNAPC3Q92966 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNAPC3Q92966 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNAPC3Q92966 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNAPC3Q92966 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNAPC3Q92966 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNAPC3Q92966 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNAPC3Q92966 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNAPC3Q92966 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNAPC3Q92966 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNAPC3Q92966 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNAPC3Q92966 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNAPC3Q92966 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SNAPC3Q92966 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNAPC3Q92966 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNAPC3Q92966 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNAPC3Q92966 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNAPC3Q92966 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNAPC3Q92966 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNAPC3Q92966 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNAPC3Q92966 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNAPC3Q92966 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNAPC3Q92966 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNAPC3Q92966 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SNAPC3Q92966 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNAPC3Q92966 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNAPC3Q92966 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms