Protein–RNA interactions for Protein: Q92769

HDAC2, Histone deacetylase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC2Q92769 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC2Q92769 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC2Q92769 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC2Q92769 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC2Q92769 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC2Q92769 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC2Q92769 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC2Q92769 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HDAC2Q92769 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDAC2Q92769 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDAC2Q92769 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC2Q92769 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC2Q92769 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC2Q92769 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC2Q92769 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC2Q92769 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC2Q92769 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC2Q92769 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC2Q92769 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC2Q92769 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC2Q92769 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC2Q92769 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC2Q92769 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC2Q92769 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC2Q92769 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC2Q92769 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC2Q92769 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC2Q92769 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC2Q92769 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC2Q92769 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HDAC2Q92769 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HDAC2Q92769 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HDAC2Q92769 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HDAC2Q92769 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HDAC2Q92769 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HDAC2Q92769 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HDAC2Q92769 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC2Q92769 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC2Q92769 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDAC2Q92769 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDAC2Q92769 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDAC2Q92769 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDAC2Q92769 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC2Q92769 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC2Q92769 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC2Q92769 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC2Q92769 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC2Q92769 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDAC2Q92769 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDAC2Q92769 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HDAC2Q92769 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HDAC2Q92769 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HDAC2Q92769 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HDAC2Q92769 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HDAC2Q92769 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HDAC2Q92769 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HDAC2Q92769 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HDAC2Q92769 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HDAC2Q92769 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HDAC2Q92769 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HDAC2Q92769 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HDAC2Q92769 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HDAC2Q92769 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HDAC2Q92769 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HDAC2Q92769 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HDAC2Q92769 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
HDAC2Q92769 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HDAC2Q92769 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HDAC2Q92769 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HDAC2Q92769 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HDAC2Q92769 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HDAC2Q92769 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HDAC2Q92769 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HDAC2Q92769 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HDAC2Q92769 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HDAC2Q92769 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HDAC2Q92769 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HDAC2Q92769 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HDAC2Q92769 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HDAC2Q92769 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HDAC2Q92769 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HDAC2Q92769 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC2Q92769 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC2Q92769 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC2Q92769 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC2Q92769 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC2Q92769 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC2Q92769 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDAC2Q92769 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDAC2Q92769 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDAC2Q92769 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDAC2Q92769 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDAC2Q92769 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDAC2Q92769 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDAC2Q92769 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDAC2Q92769 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDAC2Q92769 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDAC2Q92769 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC2Q92769 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC2Q92769 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.4 ms